默認分類(lèi) 2007-12-25 17:52:51 閱讀991 評論0 字號:大中小 訂閱
一.所需儀器設備
1.電泳儀
2.垂直電泳槽
3.轉移電泳槽:濕轉或半干轉電泳槽
4.硝酸纖維素膜(NC膜)
5.暗盒
6.5x7cm X膠片
[注:電泳槽、玻璃板、梳子及膠條的清洗:自來(lái)水沖洗數次――去離子水沖洗數次2次――37C烤干備用。]
二.所用試劑
[注:配制及稀釋試劑均用去離子水,實(shí)驗器皿自來(lái)水清洗完畢再用去離子水沖洗]
1.Lysis buffer:RIPA 三去污劑裂解緩沖液
50mM Tris.Hcl 3.03g
150mM NaCl 生理鹽水 4.35g
0.02%NaN3(防腐劑,可以不加) 0.1g
0.1%SDS 強陰離子去污劑 0.5g
1% NP-40 去污劑 5ml
0.5% Sodium deoxycholate 去氧膽酸鈉 去污劑 2.5g
配制500ml,10M鹽酸調PH8.0, 4度保存。
使用前按1:50加入100mM PMSF(苯甲基磺酰氟,平時(shí)放-20度)和protease inhibitor(先溶在2ML水中,分裝在小管中,保存在-20度),配好后馬上使用。也可分裝成(RIPA300ul+6ul100mM PMSF+6ulprotease inhibitor)(培養細胞及微小組織蛋白提取)若干管,-20度保存;分裝成(RIPA1000ul+20ul100mM PMSF+20ulprotease inhibitor)(較大組織蛋白提取)若干管,-20度保存。
[注:也可使用單去污劑裂解緩沖液,將1% NP-40換為1%Triton X-100。去掉0.1%SDS及0.5% Sodium deoxycholate 去氧膽酸鈉]
PMSF儲存液 100mM(17.4mg/ml),溶于異丙醇。有效濃度100ug/ml。
2.150mM Nacl(0.87%Nacl,生理鹽水)
3.0.1mg/mL考馬斯亮蘭G-250溶液 蛋白定量用。用50ml 95%乙醇溶解100mg考馬斯亮蘭G-250,再加入100ml 85%磷酸,加水至1000ml。用Whatman濾紙過(guò)濾后,置棕色瓶4度保存。蛋白定量比色皿可用95%乙醇脫色。
4.考馬斯亮蘭脫色液 含50%甲醇、10%冰醋酸、40%去離子水。
5. 0.25%考馬斯亮蘭R-250溶液 染色用。100ml脫色液中加入0.25g考馬斯亮蘭R-250。
6.10mg/mlBSA,稱(chēng)取100mg小牛血清白蛋白溶于10ml滅菌去離子水中。置-20度冰箱保存。
7.1mol/L Tris-Hcl緩沖液,PH6.8
8.1.5 mol/L Tris-Hcl緩沖液,PH8.8
9.10% AP:過(guò)硫酸銨(Ammonium Persulfate,AP),Amresco分裝,為促凝劑,現配現用,準確稱(chēng)取AP 20mg于0.5ml離心管內(注:稱(chēng)量時(shí)可分裝數管室溫保存備用)臨用前加去離子水200ul溶解。配制好的AP溶液4C可保存1周。
10.TEMED,Amresco分裝,100ml包裝,為促凝劑,準確吸取TEMED 10ul于0.2ml離心管內,可分裝數管室溫保存備用。
11.10% SDS 在90ml去離子水中溶解10g電泳級SDS,加熱至68℃助溶,加入幾滴濃鹽酸調節溶液的pH值至7.2,加入去離子水定容至100ml,室溫保存。
12.30% Acr 將29g丙烯酰胺和1gN,N’-亞甲雙丙烯酰胺溶于總體積為60ml的水中,加熱至37℃溶解之,補加水至終體積為100ml。用Nalgene濾器(0.45孔徑)過(guò)濾除菌查證該溶液的pH值應不大于7.0,置棕色瓶中4度保存。
13.6xLoading buffer:6倍sample buffer
300mM tris.Hcl pH=6.8 , 12% SDS ,0.6% bromophenol blue (溴酚藍),60%Glycerol,甘油
Filted,分裝在1ml tube, 每毫升加43ul B-ME(β-巰基乙醇,還原劑),-20度保存。
14.蛋白Marker: 選擇最適分子量Marker(MBI公司蛋白Marker很好)
15.內參:可選擇最適分子量?jì)葏⒆?:3000-5000稀釋?zhuān)鏐-Actin(45KD,漿蛋白用)、GAPDH(36KD,漿蛋白用,上??党缮锝?jīng)銷(xiāo))、B-Tubulin(核蛋白用)等。
16.1xTris-Glycine電泳緩沖液(PH8.3)
25mM tris,192mM Glycine, 0.1%(w/v)SDS,
500ml配方如下
Tris1.515g, glycine7.2g, SDS0.5g用去離子水加至500ml。加10M HCl約800ul,就可以調至pH8.3。
17.1xTransfer buffer(PH8.3)
25mM tris, 192mM Glycine, 20%Methanol(甲醇),ph為8.3
500ml配方如下
Tris 1.515g,glycine7.2g,100ml Methanol(甲醇),用去離子水加至500ml。加10M HCl約550ul,就可以調至pH8.3。
18. TBST Washing buffer:
50mM tris, 150mM Nacl, 0.1% Tween-20
1L配方如下
Tris 6.06g,NaCl8.7g,1mlTween-20,加入去離子水至1L,同時(shí)精確調準pH值為7.6。加10M HCl約4200ul,就可以調至7.6。Tween-20要在用前現加,未加Tween-20的稱(chēng)為T(mén)BS緩沖液。
19.5%的脫脂奶粉封閉液 用TBST Washing buffer配制。
20.一抗:santa原裝或北京中山分裝,一般做1:200-300稀釋。
21.HRP標記二抗:一般做1:3000-5000稀釋。二抗選擇原則如下:
如一抗為鼠抗人IgG, 二抗選擇羊抗(或兔抗)鼠HRP;
如一抗為羊抗人IgG, 二抗選擇鼠抗(或兔抗)羊HRP;
如一抗為兔抗人IgG, 二抗選擇羊抗(或鼠抗)兔HRP。
22.ECL化學(xué)發(fā)光顯色劑,或DAB顯色劑
三.總蛋白質(zhì)提取
1.培養細胞
1.1貼壁細胞數目達到培養皿(或培養瓶)底面積80-90%,最好前一天換上新的培養液。
1.2將培養液吸凈,用5ml左右4度PBS洗三次細胞平皿(洗凈培養液中的胎牛血清等外源性蛋白),將PBS吸凈,加入triple-detergent lysis buffer,100mm培養皿加300ul。(蛋白質(zhì)種類(lèi)不同—漿蛋白、核蛋白、膜蛋白,細胞裂解液有所不同)如暫時(shí)不提取,可將培養皿-80度保存。
1.3輕輕的轉動(dòng)培養皿直到細胞被溶解下來(lái),細胞刮輕輕刮下裂解物,并可見(jiàn)白色的核酸(DNA、RNA)沉淀,(約1分鐘)將所有的液體包括沉淀,吸入1.5ml離心管,旋渦混勻器30秒,放在冰上10分鐘使細胞充分裂解,然后,用4度離心機12000轉10分鐘。
1.4留10ul上清液做蛋白定量外,其余上清于另一1.5ml離心管(將蛋白樣品5份+1份6×loading buffe,6×loading buffe加入前用80度左右的水預熱一下,使其溶解充分。把樣品在100度的沸水中煮5分鐘使蛋白變性,離心管上標明蛋白含量,保存在-80度冰箱)
2.組織中蛋白提取
2.1特小的組織加300ulLysis buffer玻璃勻漿器中,冰浴中研磨數次,勻漿上清液吸入1.5ml離心管中,然后,用4度離心機12000轉10分鐘。吸取上清于另一1.5ml離心管,分裝,保存在-80度冰箱。留10ul上清液做蛋白定量。
2.2取50-100mg組織放入玻璃勻漿器中,加3倍體積Lysis buffer,冰浴中研磨數次,勻漿上清液吸入1.5ml離心管中,然后,用4度離心機12000轉10分鐘。吸取上清于另一1.5ml離心管,分裝,保存在-80度冰箱。留10ul上清液做蛋白定量。
四.蛋白質(zhì)定量
1.應用標準的Bradford法定量。
2.待測樣本各10ul+90ul生理鹽水;標準管中分別加入10mg/mlBSA 0ul、2.5ul、5.0ul、7.5ul、10ul, 每管加生理鹽水至100ul(蛋白含量分別為0、25、50、75、100ug),同時(shí)以100ul的生理鹽水作空白對照。各管加入考馬斯亮藍染料溶液1900ul至總體積2ml,混勻,室溫放置2分鐘。比色檢測作標準曲線(xiàn),計算出各個(gè)樣品的蛋白含量。
3.比色定量:通過(guò)OD值,來(lái)計算蛋白量。統計軟件計算出結果;
五.樣品準備
1.將已定量的蛋白樣品5份+1份6×loading buffe,6×loading buffe加入前用80度左右的水預熱一下,使其溶解充分。把樣品在100度的沸水中煮5分鐘, (水中煮沸5分鐘,目的是讓蛋白變性,由四級結構變成一級結構。注意事項:煮沸時(shí),一定不要讓離心管口彈開(kāi)進(jìn)入水,要隨時(shí)觀(guān)察。)
2.一般來(lái)講蛋白上樣量30ug;計算出每個(gè)樣品30ug所用的體積,在樣品管上標記體積數值,以后直接吸取就行了。
3.等體積上樣:用事先準備好1×loading buffer,調成15ul相同體積。這樣條帶整齊。
六.蛋白電泳
1.分離膠制備
1.膠的選擇:膠的濃度越大,所能分離蛋白的分子量越小。(阿恒覺(jué)得這里一般還是10%到15%的比較常用)
7.5% :45—200KD
10%: 31----200KD
12%: 21.5---200KD
15%6.5---200KD
2.10ml 10%分離膠制備
去離子水 3950ul
30%Acr 3350ul
1.5MTris-Hcl,PH8.8 2500ul
10%SDS 100ul
混勻;依次快速加入10%AP 100ul及TEMED 4ul,充分混勻但不要產(chǎn)生氣泡。(這部很關(guān)鍵)
3.立即灌膠,不要產(chǎn)生氣泡,如有氣泡可用10ml注射器針頭排除。在每側膠板加膠至紅色塑料板的下緣處即可(差不多4-5ml)
4.沿玻璃板壁緩慢加去離子水1cm高度,隔絕空氣,分離膠室溫凝固2小時(shí)以上。也可4度冰箱過(guò)夜。
2.5%積層膠制備
(配制積層膠前先傾斜玻璃板,使上面水層匯聚于一邊,用10ml注射器吸取干凈,靜置10分鐘左右,使水分蒸發(fā)干凈)
2.1 4ml 5%積層膠制備
去離子水 2800ul
30%Acr 660ul
1MTris-Hcl,PH6.8 500ul
10%SDS 40ul
混勻;依次快速加入10%AP 40ul及TEMED 4ul,充分混勻但不要產(chǎn)生氣泡。立即灌膠,不要產(chǎn)生氣泡,如有氣泡可用10ml注射器針頭排除。
2.2插上梳子,積層膠室溫凝固30分鐘以上。小心撥出梳子,若膠孔有歪斜,則用注射器加以修正,吸出氣泡;(歪斜一般出現在基層膠凝固時(shí)間過(guò)短,或者配置比重過(guò)低,可用針頭撥亂反正之,但是難度很高,容易挑破)
2.3去掉膠條,加入甘氨酸電泳緩沖液,內外持平;
2.4清洗膠孔:去除沒(méi)有凝聚的Acr,并清除氣泡。
3.點(diǎn)樣:使用20ul的加樣槍?zhuān)捎?#8220;對側加樣法”加樣。
4.電泳
電泳在4度冰箱中進(jìn)行,積層膠90V,30分鐘左右,待溴酚蘭指示劑到達分離膠表面時(shí)改變電壓120-130V,2小時(shí)左右――此方法可以保持膠內受熱均勻,電流、電場(chǎng)均勻,條帶齊規整)
5.剝離膠:在平皿中,用手術(shù)刀片小心剝離,切掉積層膠,取出分離膠,用于下一步試驗。
七.轉膜
1.準備一大的玻璃培養皿,
2.Tansfer buffer:配制500ml(一部分倒于玻璃皿中,以分離膠-制作夾心餅);取膠-修剪膠:取膠時(shí)手應錯開(kāi)分離玻璃,使膠取出,去掉積層膠部分,修剪周邊使其與預先制作好的硝酸膜大小一致,約長(cháng)8cm、高5cm左右,NC膜用剪刀在一個(gè)角剪一個(gè)標記;制作夾心餅:黑負白正,從近負極面依次為“黑夾板=海棉-濾紙(5層)-膠-膜-濾紙(5層)-海棉=白夾板”形象“漢堡”或“夾心餅”;用玻璃棒趕盡氣泡](這步要一層層的趕氣泡,氣泡非常影響轉膜結果)
3. Transfer time
4度6-12小時(shí)(4C轉膜過(guò)夜,時(shí)間根據分子量的大小調整,大分子可以12小時(shí),小的6小時(shí)左右)
4.將膜取下,用去離子水洗。
八.Western blot
blot之前可以用麗春紅(ponceaus)染NC膜,以觀(guān)察蛋白轉膜情況(是否完全、條帶是否齊)。然后用自來(lái)水或washing buffer洗掉麗春紅后進(jìn)行印跡??梢耘軆蓧K膠,一塊blot,一塊染色觀(guān)察。(其實(shí),恩,染過(guò)色的膠洗掉還是可以用的,吼吼?。?
步驟:
1.裁膜:根據電泳后蛋白Marker的位置,裁剪所需目的蛋白、內參對應的膜。
2.封閉抗體:將膜放入自制blot袋;封閉液用5%的美國脫脂奶粉(用TBST wash buffer配制),blot with milk for 1h RT,也可4度過(guò)夜。(這個(gè)做袋袋,也是很有意思地 = = 哈哈?。?
3.加一抗:blot in primary antibody for 1.5h RT(抗體用milk稀釋?zhuān)?
4.洗膜:wash with TBST wash buffer 5times, each time 3mins
5.加二抗:blot in secondary antibody 1h RT (抗體用milk稀釋?zhuān)?
6.洗膜:wash with TBST wash buffer 5times, each time 3mins
九ECL顯色
1.加ECL試劑10ml于100mm玻璃培養皿中,再加30%雙氧水6ul(帶上手套,防止腐蝕皮膚)(萬(wàn)一腐蝕了,皮膚變成白色的,又疼又養,這是一個(gè)比偶倒霉的哥哥告訴偶的),搖勻。
2.用濾紙吸干NC膜上水分,將膜放入ECL顯色液中顯色,肉眼看到條帶后,就可以取出,顯色強的約幾秒鐘,顯色弱的時(shí)間長(cháng)些,但是不可以超過(guò)3分鐘。
十.放射自顯影,沖洗膠片
1.放射自顯影操作在暗室進(jìn)行。紅色燈光下可避免底片曝光。切忌底片濕水。
2.用濾紙吸干膜上ECL顯色液,先將膜放入暗盒內,再放X膠片,根據目的條帶ECL顯色的強弱決定曝光時(shí)間。 (伸手不見(jiàn)5指的曝光,經(jīng)常大眼瞪小眼的看條帶)
3.目的條帶ECL顯色肉眼可以看到的話(huà),說(shuō)明比較強,曝光時(shí)間可以短些,“3分鐘、5分鐘各一張+必不可以少的10分鐘一張”;肉眼看不見(jiàn),曝光時(shí)間可以長(cháng)些,“不可以少的10分鐘,15分鐘、30分鐘各一張”。
4.一般來(lái)說(shuō),曝光三張已足夠用。(偶一口氣爆上6張,左眼看3張,右眼看3張,嘿嘿~~)
5.放射科沖洗X膠片,讀片。
6.X膠片掃描保存。
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