近二十年來(lái)水產(chǎn)養殖業(yè)迅猛發(fā)展，集約化高密度養殖規模日益擴大，與此同時(shí)，未經(jīng)處理的養殖廢水和工業(yè)、生活污水的排放使水體受到嚴重污染，養殖生態(tài)環(huán)境遭到破壞，導致病原微生物種類(lèi)增多和傳播速度加快，養殖生物病害發(fā)生日趨嚴重，給水產(chǎn)養殖業(yè)造成嚴重損失。據不完全統計，每年全國發(fā)生中等程度以上的養殖病害面積占養殖總面積的15％～20％，產(chǎn)量損失超過(guò)100萬(wàn)噸。目前，主要使用藥物來(lái)控制病害的發(fā)生，一些嚴重威脅養殖動(dòng)物的病害，由于藥物的使用而得到不同程度的控制，但是也應該看到藥物防治存在的弊端也越來(lái)越明顯，比如過(guò)度使用抗生素藥物不僅使細菌耐藥性增加，破壞和干擾養殖環(huán)境的正常微生物區系，導致微生物的生態(tài)失調，產(chǎn)生二重感染，還使抗生素在生物體內殘留、富集，最終將會(huì )對人體構成危害。
根據可持續發(fā)展的觀(guān)點(diǎn)，建立清潔養殖模式，是保持水產(chǎn)養殖健康、穩定發(fā)展的重要手段，其中微生態(tài)制劑無(wú)毒、無(wú)副作用，無(wú)殘留污染，不產(chǎn)生抗性，能有效的改善養殖生態(tài)環(huán)境，提高養殖動(dòng)物的免疫能力，減少疾病的發(fā)生，增進(jìn)健康、促進(jìn)生長(cháng)，維持養殖生態(tài)平衡。用于水產(chǎn)養殖的微生態(tài)制劑應該包括細菌、真菌、藻類(lèi)及其代謝產(chǎn)物在內，旨在改善動(dòng)物腸道環(huán)境和水生態(tài)環(huán)境的微生物平衡，增強免疫防御能力，抑制病原微生物，促進(jìn)動(dòng)物生長(cháng)。
復合微生態(tài)制劑的各類(lèi)有益菌的使用，需要科學(xué)的使用，否則會(huì )造成效果不明顯或是反作用。如光合細菌需要光照，無(wú)氧，有機物豐富；硝化細菌、枯草芽孢桿菌卻需要溶氧，氧氣不足只能降低氨氮，不能降亞硝酸鹽。外用時(shí)應針對具體情況，加以選用有針對性的功能菌（如光合菌粉、枯草芽孢桿菌等），并不能一味的使用復合微生態(tài)制劑，也就是說(shuō)，良好的水質(zhì)更宜于使用復合微生態(tài)制劑；對于不良水質(zhì)，則不同，必需結合養殖水體的情況對癥使用功能菌。內服：有益菌拌料能提高飼料轉化率，降低糞便中的有害物質(zhì)，從腸道不斷排出的活菌能穩定地凈化水質(zhì)，不會(huì )因外用活菌的突然進(jìn)入破壞生態(tài)平衡，而且成本低。
將微生態(tài)制劑直接加入養殖地要注意環(huán)境是否適合有益菌的生存和繁殖。如水體加人了抗生素等化學(xué)物質(zhì)，就會(huì )降低微生態(tài)制劑的作用效果。微生態(tài)制劑的加入量要求使有益菌成為優(yōu)勢菌，在養殖水體才能發(fā)揮最大的作用，因此如果中間換水和使用消毒劑，應在換水后或使用消毒劑幾天后補加首次使用的劑量。
微生態(tài)制劑對養殖水體的生物修復存在一些局限性，養殖水體的水型較為復雜，有海水、內陸鹽水、淡水之分，也有按鹽型的不同劃分的鹽酸鹽型、碳酸鹽型、硫酸鹽型、硝酸鹽型等水型，而每一種微生物都有其特定的生存適應環(huán)境要求，微生態(tài)制劑中的特定有益菌只能降解特定類(lèi)型的化學(xué)物質(zhì)，狀態(tài)稍有變化的化合物就不可能被同一微生物所降解或破壞，微生態(tài)制劑并不能適用于所有養殖水體環(huán)境或不能降解所有養殖環(huán)境中的有毒有害物質(zhì)。
我們要注意以下幾個(gè)方面：
?。ㄒ唬脤ο蠛铜h(huán)境的限制性問(wèn)題
對于微生態(tài)制劑的不同施用對象的毒力變化、施用后對養殖環(huán)境的影響、對宿主的有害作用及致病性問(wèn)題等都要進(jìn)行深入研究，因為有些菌為有條件致病性，可能無(wú)毒或無(wú)致病性的分離株在釋放入環(huán)境或用到宿主后發(fā)生變異，從而產(chǎn)生致病能力，這一點(diǎn)往往容易被忽視。
?。ǘ┓N屬特異性和環(huán)境適應性問(wèn)題
某些特異來(lái)源的菌株可能對分離動(dòng)物或分離地的環(huán)境具有更突出的作用，當環(huán)境或分離物改變后，其作用也會(huì )有所變化。
?。ㄈ┡湮榈暮椭C性問(wèn)題
對于復合微生態(tài)制劑而言，相互配合在一起應用的有兩個(gè)以上或多個(gè)菌種，這些菌種并非是各個(gè)單獨發(fā)揮作用，在一定條件下，他們之間也會(huì )產(chǎn)生相互影響，如拮抗或抑制作用等，從而失去配合的意義，甚至會(huì )產(chǎn)生相反的結果。
?。ㄋ模λ蛭⑸鷳B(tài)的影響問(wèn)題
因有的微生物是有條件致病性的，在特定的條件下會(huì )產(chǎn)生我們所希望的作用，而在另一種特定條件下會(huì )產(chǎn)生相反的作用。而在從事微生態(tài)制劑開(kāi)發(fā)應用過(guò)程中，大多只是在特定的條件下進(jìn)行試驗，并未對各種水域條件進(jìn)行試驗，從而出現在實(shí)際生產(chǎn)應用過(guò)程中效果不穩定或出現相反結果的原因所在。
因此，要在已有的研究基礎上，研究測水施用技術(shù)。對于不同水型確定不同微生物種的配伍、用法與用量等技術(shù)內容，確保使用的有效性。
有關(guān)專(zhuān)家學(xué)者指出，對于水產(chǎn)養殖動(dòng)物而言，藥物防治疾病只是暫時(shí)性的手段，而且存在著(zhù)對產(chǎn)品食用安全性等問(wèn)題；生態(tài)防治才是解決問(wèn)題的基本出路。因此，要加強對微生物群的作用特點(diǎn)和優(yōu)化養殖水域生態(tài)結構的研究，使養殖活動(dòng)良性循環(huán)發(fā)展，才能取得更大的經(jīng)濟、社會(huì )和生態(tài)效益。長(cháng)期合理地應用微生態(tài)制劑必定會(huì )使養殖水域形成有益微生物菌群的生態(tài)優(yōu)勢，起到促進(jìn)養殖活動(dòng)健康發(fā)展的良性循環(huán)作用。
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