《傷寒論》序文中：感往昔之淪喪，傷橫夭之莫救，乃勤求古訓，博采眾方，撰用《素問(wèn)》、《九卷》、《八十一難》、《陰陽(yáng)大論》、《胎臚藥錄》，并平脈辨證，為《傷寒雜病論》，合十六卷。
因此后世多認為仲景據內經(jīng)撰寫(xiě)而成《傷寒論》。故歷代諸多醫家認為《傷寒論》的理論來(lái)源于內經(jīng)，如宋代成無(wú)己的《注解傷寒論》、《傷寒明理論》等以經(jīng)解經(jīng)，用內經(jīng)的理論解釋《傷寒論》的理論基石就是認為《傷寒論》的理論來(lái)源于內經(jīng)。
在《漢書(shū)藝文志》中，已經(jīng)很明確指出有經(jīng)方、醫經(jīng)的不同學(xué)派。其中內經(jīng)的理論體系是臟腑、經(jīng)絡(luò )為主，后世臟腑、時(shí)方多用內經(jīng)理論指導。而采用臟腑的內經(jīng)體系理論去理解傷寒，很多地方難以解釋的通，不能窺得仲景經(jīng)方原意。所以歷代醫家以?xún)冉?jīng)釋傷寒，越解越難明。
皇甫謐在《甲乙經(jīng)序》云：“伊尹以元圣之才，撰用《神農本草》以為《湯液》，漢張仲景論廣湯液為十數卷，用之多驗”。稱(chēng)其書(shū)為“論廣湯液”。陶弘景在《輔行訣臟腑用藥法要》曰：昔南陽(yáng)張機依此諸方，撰為《傷寒論》一部。宋高保衡等認為“仲景本伊尹之法，伊尹本神農之經(jīng)”，可見(jiàn)仲景學(xué)有所承。承自于《神農本草經(jīng)》、《湯液經(jīng)法》。
現代錢(qián)超塵教授及近代的楊紹伊等經(jīng)過(guò)考證后，均認為《傷寒論》序中“撰用”以下的23字為后人所加，非仲景文字。近代傷寒大家胡希恕先生經(jīng)過(guò)畢生實(shí)踐及研究后明確提出《傷寒論》屬于經(jīng)方一脈，而內經(jīng)屬于針灸家言，二者源流不同，故不能以?xún)冉?jīng)釋傷寒?？梢?jiàn)《傷寒論》并不是沿用了內經(jīng)的理論，同樣《傷寒論》的六經(jīng)也不是來(lái)源于內經(jīng)的六經(jīng)。（馬家駒）
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