今天查看密碼子表格時(shí)發(fā)現起始密碼子是AUG，但我經(jīng)?？吹降腸ds序列起始密碼子是ATG，這兩個(gè)哪種正確呢？感覺(jué)時(shí)間太久了，有些概念記不清了，今天來(lái)總結復習一下codon，cds，mRNA之間的關(guān)聯(lián)。
要了解codon，cds，mRNA，sense strand，ATG，AUG之間的關(guān)系，要先了解DNA組成鏈和轉錄的關(guān)系
如圖所示，DNA一般共有2條鏈，被稱(chēng)為雙鏈DNA(dsDNA)。轉錄時(shí)DNA的1條鏈被選為轉錄模版，這條鏈被稱(chēng)為轉錄鏈，模版鏈，非編碼鏈或者反義鏈，英文名稱(chēng)是 antisense strand。反義鏈轉錄為mRNA，進(jìn)行下一步的翻譯。mRNA中含有密碼子(codon)。
另一條沒(méi)有被轉錄的鏈被稱(chēng)為正義鏈，編碼鏈，非轉錄鏈，非模版鏈，英文名稱(chēng)是sense strand。這條鏈和mRNA的堿基序列一致，區別就是，mRNA中沒(méi)有T(胸腺嘧啶)，只有U(尿嘧啶)。這也是密碼子中ATG或者AUG都可以翻譯成甲硫胺酸的原因。正義鏈中也具有密碼子。
為了更便于理解正義鏈和反義鏈的區別，總結兩者主要區別如下：
1.正義鏈是編碼鏈，而反義鏈是非編碼鏈。
2.正義鏈類(lèi)似于RNA，只是DNA中的胸腺嘧啶對應RNA中的尿嘧啶，其他堿基保持一致。另一方面，反義鏈充當RNA合成的模板。
3.正義鏈具有密碼子，反義鏈中沒(méi)有密碼子。
4.正義鏈將不具有mRNA的相關(guān)序列，反義鏈卻具有。
到這里我們知道了mRNA是和DNA正義鏈序列一致的，只不過(guò)mRNA里面沒(méi)有T，替換為了U。
接下來(lái)了解CDS序列，需要先知道DNA的分區以及具體轉錄過(guò)程。
DNA可以分為編碼區和非編碼區。編碼區由外顯子和內含子組成。DNA的編碼區經(jīng)過(guò)轉錄，生成了hNRNA，也稱(chēng)為不均一核RNA。hnRNA又分為外顯子轉錄區域和內含子轉錄區域，經(jīng)過(guò)剪切這一步，內含子轉錄區域被刪掉，只剩下內含子轉錄區域被拼接到一起，星辰了mRNA。mRNA又分為cds，一段編碼蛋白質(zhì)的序列，以及UTR，即非翻譯區，不能編碼蛋白質(zhì)的序列。
總結來(lái)說(shuō)，NCBI中的cds序列就是mRNA序列中的可編碼區域，只不過(guò)為了保證數據的統一性，為了下游的方便分析處理，mRNA的序列還是用T來(lái)表示U。所以密碼子表中的AUG沒(méi)有錯，cds序列中的ATG也沒(méi)有錯。
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