本文來(lái)自微信公眾號:科學(xué)大院(ID:kexuedayuan),作者:李頡(中國科學(xué)院青島生物能源與過(guò)程研究所),頭圖來(lái)自unsplash
在浩瀚無(wú)邊的宇宙中,塵埃、星云在漫無(wú)目的地游蕩,星球按照自己的軌跡日復一日、年復一年地運轉。這宇宙似乎是如此的孤寂,除了那顆湛藍的星球,它是那么的與眾不同,因為它孕育著(zhù)千姿百態(tài)的生命。我們總會(huì )在仰望星空,細聽(tīng)蟬鳴蛙叫的時(shí)候問(wèn)道:生命的起源是什么?
在對生命起源的探索過(guò)程中,最難以捉摸的是遺傳物質(zhì)的出現。四十億年前,古地球的“原始湯”隨周遭環(huán)境變化發(fā)生了一系列化學(xué)反應,最終產(chǎn)生了某種成為如今絢爛多彩的億萬(wàn)生命起點(diǎn)的物質(zhì)。多年來(lái),科學(xué)家們一直在探索,承擔“生命起點(diǎn)”這一偉大使命的物質(zhì)是一種什么形式?它,又是從何時(shí)、何地、因何種契機出現的呢?
探索生命起源(圖片來(lái)源:作者繪制)
生命可能起源于RNA?
關(guān)于生命起源的猜測有很多,其中沃特·吉爾伯提出的 “RNA世界學(xué)說(shuō)”得到了諸如克里克等人的支持。RNA世界學(xué)說(shuō)認為:生命最初可能是以RNA的形式出現,隨著(zhù)環(huán)境的改變,進(jìn)化出現了如今的DNA和蛋白質(zhì)。最初的RNA具有與如今DNA分子一般的儲存遺傳信息的功能,以及如蛋白酶一般的催化功能,為早期的細胞或者生命運動(dòng)提供了一切所需的前提條件。
一個(gè)假想RNA世界的起源模式(圖片來(lái)源:百度百科)
很多科學(xué)家對“RNA世界學(xué)說(shuō)”堅信不疑,因為現存生命的一些跡象表明RNA可能是更為古老的生物大分子。
在如今生物世界的核心——中心法則中,RNA占據了中心位置,起到了“承上啟下”的橋梁作用;
根據演化由簡(jiǎn)單到復雜的規律,具有更為簡(jiǎn)單結構的RNA很可能是生物大分子的起源;
RNA功能多樣,能夠承擔DNA遺傳信息載體的功能(如:復制)以及蛋白質(zhì)的生命執行功能(如:催化);
DNA的合成也離不開(kāi)RNA的協(xié)助。
可以看到,種種跡象都在提示我們一種可能性:RNA是生命的起點(diǎn)。
作為原始遺傳物質(zhì)的必備“技能”
RNA的“存儲技能”
RNA在結構上與DNA十分相似,而且也能夠進(jìn)行自我復制,這使得二者對于遺傳信息的存儲是類(lèi)似的。在“RNA世界學(xué)說(shuō)”中,它之所以被認為是生命的起點(diǎn)物質(zhì),主要是因為在生物合成途徑上的先后順序——從化學(xué)角度以及分子結構來(lái)看,DNA與RNA的差別就在于羥基(-OH)的有無(wú),可以認為DNA是通過(guò)移除RNA上的羥基所形成的。所以,很多科學(xué)家就認為,合成DNA的前提是RNA能夠先在細胞中生成。
DNA(脫氧核糖核苷酸)和RNA(核糖核苷酸)結構式(圖片來(lái)源:作者繪制)
RNA通常以較為簡(jiǎn)單的單鏈形式呈現,這種結構使得它就像初生沒(méi)有完全發(fā)育的幼鳥(niǎo),它掌握的技能不多也不夠精確,但它對一切充滿(mǎn)好奇,“性格活潑”但又 “體質(zhì)”虛弱,所以面對外界環(huán)境的沖擊比較容易受到“傷害”,稍有不慎可能半路“夭折”——被降解。
然而,這并沒(méi)有限制住RNA儲存遺傳信息的能力。作為結構簡(jiǎn)單的“新生兒”它具有無(wú)限可能,通過(guò)環(huán)境的塑造,它可以做出各種改變,這也使得進(jìn)化成為可能。從進(jìn)化的角度看,簡(jiǎn)單的分子總是最先出現,從不穩定向更穩定的方向進(jìn)化,從功能簡(jiǎn)單廣泛向專(zhuān)一化發(fā)展,所以RNA可能是先于DNA出現的遺傳物質(zhì)。
RNA的“催化技能”
具有催化能力的RNA,被稱(chēng)作核酶。如今已知的天然RNA催化劑大部分參與RNA的加工從而形成成熟的RNA分子。核糖體RNA(rRNA)和核糖核酸酶P(RNase P)便是具有催化能力的RNA,即核酶。
rRNA是核糖體的組成成分之一,除此之外還有核糖體蛋白質(zhì)。其中rRNA在所有活細胞中都有發(fā)現,它負責催化,將所有的氨基酸元件一個(gè)接一個(gè)的按照模板組裝,形成具有特定功能的蛋白質(zhì)。
RNase P,是蛋白質(zhì)以外第一個(gè)被發(fā)現具有催化能力的分子。最開(kāi)始,人們發(fā)現有一種RNA能夠給自己進(jìn)行“化妝”,通過(guò)修改自己的結構讓自己以更“完善”的形式存在于細胞中。后來(lái),又發(fā)現有的RNase P還十分的樂(lè )于助“人”,通過(guò)對一些不能產(chǎn)生蛋白質(zhì)的RNA進(jìn)行“打扮”,使它們能夠以更有效的狀態(tài)去行使其它功能。比如說(shuō):tRNA(轉運RNA)作為體內重要的一類(lèi)RNA分子,其“初生”鏈的兩端(5’和3’端)是一種不成熟的狀態(tài),其5’端就需要RNaseP進(jìn)行“打扮”才能以一種“成熟”的姿態(tài)隆重出場(chǎng)!

RNaseP對tRNA前體進(jìn)行“打扮”——剪切5’末端,成為“成熟”的tRNA行使轉運氨基酸的功能(紅色箭頭為識別剪切位點(diǎn))(圖片來(lái)源:作者繪制)
RNA的“調控技能”
核糖開(kāi)關(guān)是mRNA(信使RNA,蛋白質(zhì)合成模板)上無(wú)法產(chǎn)生蛋白質(zhì)的一些序列,在這些位置存在一個(gè)區域叫做“適體域”可以結合一些小分子配體。與配體結合后,核糖開(kāi)關(guān)序列會(huì )像變形金剛一樣“折疊”、“變形”,從簡(jiǎn)單的單鏈狀態(tài)變?yōu)榱硪环N形狀。折疊后的序列會(huì )改變與下游RNA相互作用的狀態(tài),有的可能會(huì )使結合更加“密不可分”,有的可能會(huì )從此“分道揚鑣”,以此達到在翻譯水平調控的目的。

核糖開(kāi)關(guān)示意圖(圖片來(lái)源:作者繪制)
RNA溫度計是一類(lèi)對溫度敏感的RNA,這部分RNA通常不能用來(lái)產(chǎn)生蛋白質(zhì),但是能隨溫度變化調控基因表達。這個(gè)調控功能的發(fā)揮一般是某一部分的RNA序列結構對溫度變化做出反應,通過(guò)“變形”使RNA上核糖體結合位點(diǎn)等重要區域被暴露或遮蔽,進(jìn)而改變對相應基因的可及性,從而產(chǎn)生蛋白質(zhì)生成速率有快有慢的不同結果。
比如說(shuō),在一種能夠引起流感的利斯特菌中,其mRNA的某一部分在非體溫環(huán)境下會(huì )折疊成扁平的發(fā)夾狀結構,從而導致蛋白表達不發(fā)生;但是一旦在人體正常溫度37℃左右的條件下,該菌株中的這種RNA的發(fā)夾結構會(huì )改變,使得“障礙物”消失,蛋白表達正常進(jìn)行,進(jìn)而導致疾病發(fā)生。
所以,我們或許可以做出這樣的假設:最初,生命起源于RNA,隨著(zhù)進(jìn)化的發(fā)生,逐漸產(chǎn)生了DNA分子和蛋白質(zhì)分子。其中,結構更加穩定的DNA分子履行信息的儲存功能,而專(zhuān)門(mén)催化具有酶活性的蛋白質(zhì)取代了催化功能,構成了現代生命體系的架構。
從中心法則出發(fā):“夾心”不好做

中心法則(圖片來(lái)源:作者繪制)
從1961年Jacob和Monod證明在DNA和蛋白質(zhì)中的“夾心”是mRNA起,中心法則日趨完善:遺傳信息儲存在能夠自我復制的DNA中,通過(guò)轉錄將信息傳遞到了RNA,最后翻譯形成了生命功能的執行者——蛋白質(zhì),雖然RNA也能夠自我復制,并且逆轉錄形成DNA,但信息傳遞的起點(diǎn)是從DNA開(kāi)始,到蛋白質(zhì)結束。
直至今日,RNA的地位似乎都有些“不上不下”的尷尬,在DNA和蛋白質(zhì)面前都顯得“低人一等”:大多數生命將遺傳物質(zhì)儲存在DNA中,而生命活動(dòng)的直接執行者是蛋白質(zhì) 。
然而,從RNA世界假說(shuō)的眾多跡象來(lái)分析,RNA很可能是大BOSS級別的存在。因為在地球生命誕生伊始,它很可能是生物大分子的起源。即使在經(jīng)過(guò)漫長(cháng)的進(jìn)化的如今,它的作用仍是舉足輕重。沒(méi)有它,DNA的遺傳信息沒(méi)法繼續流傳;沒(méi)有它,蛋白質(zhì)無(wú)法合成?;蛟S,一切都是RNA一手操控,DNA只是它的“傀儡”,而蛋白質(zhì)是它的陣前大將軍!
緣來(lái)“飾”你——RNA修飾

常見(jiàn)的RNA修飾類(lèi)型(圖片來(lái)源:作者繪制)
其實(shí),即使作為“夾心”,RNA也是不可或缺的一員,畢竟,它實(shí)在是“牽一發(fā)而動(dòng)全身”的典型啊,稍加修飾,結局就可能會(huì )被改寫(xiě)。
所謂RNA修飾,就像人們在不同場(chǎng)合穿不同衣服,畫(huà)不同妝容一樣,就是對RNA分子進(jìn)行一些小小的改動(dòng),或許是直接改變外表“服飾”,或許是添加一點(diǎn)“裝飾品”等等。
近年來(lái),多種RNA修飾陸續被研究者發(fā)現,如:6-甲基腺嘌呤(m6A)、5-甲基胞嘧啶(m5C)、假尿嘧啶(Pseudo U)等,它們都具有十分重要的功能。比如說(shuō):m6A修飾在神經(jīng)系統的發(fā)育以及功能的行使中發(fā)揮不可替代的調控作用,并且能夠調控造血干細胞的定向分化,當某段特定的RNA序列有m6A修飾時(shí),生物體能夠正常發(fā)育,若缺少修飾,可能會(huì )導致神經(jīng)系統發(fā)育不完善、功能不全等后果。
隨著(zhù)對RNA修飾的研究逐漸深入,人們對轉錄后調控也有了更多的了解,RNA表觀(guān)遺傳學(xué)也越發(fā)興起。表觀(guān)遺傳就是指:在基因的序列不變的前提下,基因的轉錄或者表達出現了差異,繼而形成不同類(lèi)型的組織、細胞,不同的修飾會(huì )在不同的生理過(guò)程中發(fā)揮不同的功能。小小的改變產(chǎn)生大大的不同,實(shí)在是“細節決定成敗”??!
寫(xiě)在最后
生命的起源問(wèn)題是人們無(wú)窮無(wú)盡的好奇心的發(fā)源地,它就像是一個(gè)永恒的問(wèn)題制造機,不斷拋出誘餌,驅使我們去探索、去辯論、去研究!RNA世界假說(shuō)、小行星假說(shuō)、神創(chuàng )論等等,至今仍然沒(méi)有定論,有的研究人員通過(guò)研究提出RNA和DNA可能最初是以一個(gè)整體的形式存在的,后來(lái)才分開(kāi)履行各自的功能;也有的研究人員提出,最初的起點(diǎn)或許不是中心法則中的任何一種物質(zhì),而是硫脲(CH4N2S)這種含硫化學(xué)物質(zhì)……
一切的一切,正如一些科學(xué)家所說(shuō)的那樣:“在生命起源問(wèn)題上打上一個(gè)句號本身就是對這個(gè)問(wèn)題的輕視?!?/p>
這個(gè)世界的真相有待我們進(jìn)一步去追尋……
本文來(lái)自微信公眾號:科學(xué)大院(ID:kexuedayuan),作者:李頡,中國科學(xué)院青島生物能源與過(guò)程研究所)
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