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專(zhuān)家發(fā)現大片段DNA序列拷貝數變化可以決定黃瓜性別

據中國農科院最新消息,該院蔬菜花卉研究所蔬菜功能基因組學(xué)創(chuàng )新團隊與國內外同行合作,發(fā)現了一個(gè)大片段DNA序列拷貝數變化可以決定黃瓜的性別。相關(guān)成果發(fā)表于最新一期國際著(zhù)名學(xué)術(shù)期刊《植物細胞》。

團隊首席、中國農科院蔬菜花卉所研究員、深圳農業(yè)基因組所副所長(cháng)黃三文介紹,大片段DNA序列的結構變異(StructuralVariation,簡(jiǎn)稱(chēng)SV)包括插入/缺失、拷貝數變化和倒位等多種類(lèi)型,可引起許多人類(lèi)疾?。ㄈ缱蚤]癥和精神分裂癥)的發(fā)生;在植物中也有關(guān)于結構變異引起農藝性狀(如葉子大小和果實(shí)形狀)改變的少量報道,但對植物中結構變異產(chǎn)生的機制及其對基因功能影響的研究還鮮有報道。

該團隊在2013年構建了黃瓜全基因組變異圖譜的基礎上,繼續利用這些數據深入開(kāi)展了黃瓜SV的鑒定和分析工作,揭示了SV產(chǎn)生的主要機制,將成為研究黃瓜基因功能的重要資源,并為充分利用SV改良作物提供了理論基礎。

黃瓜是典型的雌雄異花作物,只有雌花可發(fā)育成果實(shí)。在歐洲有些品種為全雌系,整個(gè)植株全部開(kāi)雌花,因此具有較高的增產(chǎn)潛力。黃瓜全雌系產(chǎn)生的性別決定機制一直是國內外研究熱點(diǎn),多個(gè)研究團隊圍繞該問(wèn)題做了大量探索,但一直未有明確答案。該研究發(fā)現黃瓜全雌系是由一個(gè)30kb大小DNA片段的拷貝數增加引起,并且發(fā)現拷貝數增加應該最初發(fā)生在東亞的一個(gè)黃瓜材料中,后來(lái)傳播到歐洲,形成產(chǎn)量較高的黃瓜品種。這一遺傳機制對于進(jìn)一步揭示性別決定機理具有重要指導意義,并對未來(lái)培育高產(chǎn)黃瓜品種具有潛在的重要應用價(jià)值。

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