肽鍵（peptide bond）：一個(gè)氨基酸的羧基與另一個(gè)氨基酸的氨基縮合，除去一分子水形成的酰胺鍵。
肽（peptides）：兩個(gè)或兩個(gè)以上氨基酸通過(guò)肽鍵共價(jià)連接形成的聚合物。
蛋白質(zhì)一級結構(primary structure)：指蛋白質(zhì)中共價(jià)連接的氨基酸殘基的排列順序。
層析(chromatography)：按照在移動(dòng)相（可以是氣體或液體）和固定相（可以是液體或固體）之間的分配比例將混合成分分開(kāi)的技術(shù)。
離子交換層析(ion-exchange column chromatography)：使用帶有固定的帶電基團的聚合樹(shù)脂或凝膠層析柱分離離子化合物的層析方法。
透析（dialysis）：通過(guò)小分子經(jīng)半透膜擴散到水（或緩沖液）的原理將小分子與生物大分子分開(kāi)的一種分離純化技術(shù)。
凝膠過(guò)濾層析(gel filtration chromatography)：也叫做分子排阻層析（molecular-exclusion chromatography）。一種利用帶孔凝膠珠作基質(zhì)，按照分子大小分離蛋白質(zhì)或其它分子混合物的層析技術(shù)。
親和層析（affinity chromatography）：利用共價(jià)連接有特異配體的層析介質(zhì)分離蛋白質(zhì)混合物中能特異結合配體的目的蛋白或其它分子的層析技術(shù)。
高壓液相層析（HPLC，high-pressure liquid chromatography）：使用顆粒極細的介質(zhì)，在高壓下分離蛋白質(zhì)或其它分子混合物的層析技術(shù)。
凝膠電泳（gel electrophoresis）：以凝膠為介質(zhì)，在電場(chǎng)作用下分離蛋白質(zhì)或核酸等分子的分離純化技術(shù)。
SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳（SDS-PAGE，sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrohoresis）:在有去污劑十二烷基硫酸鈉存在下的聚丙烯酰胺凝膠電泳。SDS-PAGE只是按照分子大小分離的，而不是根據分子所帶的電荷和大小分離的。
等電聚焦電泳（IFE，isoelectric focusing electrophoresis）：利用特殊的一種緩沖液（兩性電解質(zhì)）在聚丙烯酰胺凝膠內制造一個(gè)pH梯度，電泳時(shí)每種蛋白質(zhì)就將遷移到它的等電點(diǎn)（pI）處，即梯度中的某一pH時(shí)，就不再帶有凈的正或負電荷了。
雙向電泳（two-dimensional electrophoresis）：是等電聚焦電泳和SDS-PAGE的組合，即先進(jìn)行等電聚焦電泳（按照pI分離），然后再進(jìn)行SDS-PAGE（按照分子大?。?，經(jīng)染色得到的電泳圖是個(gè)二維分布的蛋白質(zhì)圖。
Edman降解(Edman degradation)：從多肽鏈游離的N末端測定氨基酸殘基的序列的過(guò)程。N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯修飾，然后從多肽鏈上切下修飾的殘基，再經(jīng)層析鑒定，余下的多肽鏈（少了一個(gè)殘基）被回收再進(jìn)行下一輪降解循環(huán)。
同源蛋白質(zhì)（homologous proteins）:來(lái)自不同種類(lèi)生物、而序列和功能類(lèi)似的蛋白質(zhì)。例如血紅蛋白。
構型（configuration）：一個(gè)有機分子中各個(gè)原子特有的固定的空間排列。這種排列不經(jīng)過(guò)共價(jià)鍵的斷裂和重新形成是不會(huì )改變的。構型的改變往往使分子的光學(xué)活性發(fā)生變化。
構象（conformation）：指一個(gè)分子中，不改變共價(jià)鍵結構，僅單鍵周?chē)脑有D所產(chǎn)生的原子的空間排布。一種構象改變?yōu)榱硪环N構象時(shí)，不要求共價(jià)鍵的斷裂和重新形成。構象改變不會(huì )改變分子的光學(xué)活性。
肽單位（peptide unit）：又稱(chēng)之肽基（peptide group），是肽鏈主鏈上的重復結構。是由參與肽鍵形成的氮原子和碳原子和它們的4個(gè)取代成分：羰基氧原子、酰胺氫原子和兩個(gè)相鄰的α-碳原子組成的一個(gè)平面單位。
蛋白質(zhì)二級結構（protein secondary structure）:在蛋白質(zhì)分子中的局部區域內氨基酸殘基的有規則的排列，常見(jiàn)的二級結構有α-螺旋和β-折疊。二級結構是通過(guò)骨架上的羰基和酰胺基團之間形成的氫鍵維持的。
蛋白質(zhì)三級結構（protein tertiary structure）:蛋白質(zhì)分子處于它的天然折疊狀態(tài)的三維構象。三級結構是在二級結構的基礎上進(jìn)一步盤(pán)繞、折疊形成的。三級結構主要是靠氨基酸側鏈之間的疏水相互作用、氫鍵范德華力和鹽鍵（靜電作用力）維持的。
蛋白質(zhì)四級結構（quaternary structure）:
融解溫度(melting temperature, Tm)：雙鏈DNA融解徹底變成單鏈DNA的溫度范圍的中點(diǎn)溫度。
增色效應（hyperchromic effect）：當雙螺旋DNA融解（解鏈）時(shí)，260nm處紫外吸收增加的現象。
減色效應（hypochromic effect）：隨著(zhù)核酸復性，紫外吸收降低的現象。
核酸內切酶(endonuclease)：核糖核酸酶和脫氧核糖核酸酶中能夠水解核酸分子內磷酸二酯鍵的酶。
核酸外切酶(exonuclease)：從核酸鏈的一端逐個(gè)水解下核苷酸的酶。
限制性?xún)惹忻福╮estriction endonucleases）:一種在特殊核苷酸序列處水解雙鏈DNA的內切酶。I型限制性?xún)惹忻讣却呋拗鱀NA的甲基化，又催化非甲基化的DNA的水解；而II型限制性?xún)惹忻钢淮呋羌谆腄NA的水解。
限制酶圖譜(restriction map)：同一DNA用不同的限制酶進(jìn)行切割從而獲得各種限制酶的切割位點(diǎn)，由此建立的位點(diǎn)圖譜有助于對DNA的結構進(jìn)行分析。
反向重復序列 (inverted repeat sequence)：在同一多核苷酸鏈內的相反方向上存在的重復的核苷酸序列。在雙鏈DNA中反向重復可能引起十字形結構的形成。
重組DNA技術(shù)（recombination DNA technology）:也稱(chēng)之基因工程(genomic engineering)。利用限制性?xún)惹忻负洼d體，按照預先設計的要求，將一種生物的某種目的基因和載體DNA重組后轉人另一生物細胞中進(jìn)行復制、轉錄和表達的技術(shù)。
基因（gene）:也稱(chēng)之順?lè )醋樱╟istron）。泛指被轉錄的一個(gè)DNA片段。在某些情況下，基因常用來(lái)指編碼一個(gè)功能蛋白或RNA分子的DNA片段。
分解代謝反應（catabolic reaction）:降解復雜分子為生物體提供小的構件分子和能量的代謝反應。
合成代謝反應（anabolic reaction）：合成用于細胞維持和生長(cháng)所需要的分子的代謝反應。
反饋抑制（feedback inhibition）：催化一個(gè)代謝途徑中前面反應的酶受到同一途徑的終產(chǎn)物抑制的現象。
前饋激活（feed-forward activation）：代謝途徑中一個(gè)酶被該途徑中前面產(chǎn)生的代謝物激活的現象。
標準自由能變化（ΔG°）（standard free-energy change）:在一系列標準條件（溫度：298K；壓力：1個(gè)大氣壓；所有溶質(zhì)的濃度都是1M）下發(fā)生的反應的自由能變化。ΔG°ˊ表示pH7.0條件下的標準自由能變化。
標準還原電位（E°ˊ）（standard reduction potential）：25℃和pH7.0條件下一個(gè)還原劑和它的氧化形式在1M濃度下表現出的電動(dòng)勢。
酵解(glycolysis)：一個(gè)由10步酶促反應組成的糖分解代謝途徑，通過(guò)該途徑，一分子葡萄糖轉換為兩分子丙酮酸，同時(shí)凈生成兩分子ATP和兩分子NADH。
發(fā)酵(fermentation)：營(yíng)養分子（例如葡萄糖）產(chǎn)能的厭氧降解，在乙醇發(fā)酵中，丙酮酸轉化為乙醇和CO2。
巴斯德效應(Pasteur effect)：氧存在下，酵解速度放慢的現象。
底物水平磷酸化(substrate phosphorylation)：ADP或某些其它的核苷-5ˊ-二磷酸的磷酸化是通過(guò)來(lái)自一個(gè)非核苷酸底物的磷?；霓D移實(shí)現的。這種磷酸化與電子傳遞鏈無(wú)關(guān)。
檸檬酸循環(huán)（citric acid cycle）:也稱(chēng)之三羧酸循環(huán)(tricarboxylic acid cycle)，Krebs 循環(huán)（Krebs cycle）。是用于乙酰CoA中的乙?；趸蒀O2的酶促反應的循環(huán)系統，該循環(huán)的第一步反應是由乙酰CoA和草酰乙酸縮合形成檸檬酸。
回補反應（anaplerotic reaction）：酶催化的補充檸檬酸循環(huán)中間代謝物的供給的反應，例如由丙酮酸羧化生成草酰乙酸的反應。
乙醛酸循環(huán)（glyoxylate cycle）:是某些植物、細菌和酵母中檸檬酸循環(huán)的修改形式，通過(guò)該循環(huán)可以由乙酰CoA經(jīng)草酰乙酸凈生成葡萄糖。乙醛酸循環(huán)繞過(guò)了檸檬酸循環(huán)中生成兩個(gè)CO2的步驟。
戊糖磷酸途徑（pentose phosphate pathway）：也稱(chēng)之磷酸己糖支路（hexose monophosphate shunt）。是一個(gè)葡萄糖-6-磷酸經(jīng)代謝產(chǎn)生NADPH和核糖-5-磷酸的途徑。該途徑包括氧化和非氧化兩個(gè)階段，在氧化階段，葡萄糖-6-磷酸轉化為核酮糖-5-磷酸和CO2,并生成兩分子的NADPH；在非氧化階段，核酮糖-5-磷酸異構化生成核糖-5-磷酸或轉化為酵解中的兩個(gè)中間代謝物果糖-6-磷酸和甘油醛-3-磷酸。
糖醛酸途徑(glucuronate pathway)：從葡萄糖-6-磷酸或葡萄糖-1-磷酸開(kāi)始，經(jīng)UDP-葡萄糖醛酸生成葡萄糖醛酸和抗壞血酸的途徑。但只有在植物和那些可以合成抗壞血酸（維生素C）動(dòng)物體內，通過(guò)該途徑可以合成維生素C。
無(wú)效循環(huán)（futile cycle）：也稱(chēng)之底物循環(huán)（substrate cycle）。一對催化兩個(gè)途徑的中間代謝物之間循環(huán)的方向相反、代謝上不可逆的反應。有時(shí)該循環(huán)通過(guò)ATP的水解導致熱能的釋放。例如，葡萄糖＋ATP＝葡萄糖-6-磷酸＋ADP與葡萄糖-6-磷酸＋H2O＝葡萄糖＋Pi反應組成的循環(huán)反應，其凈反應實(shí)際上是ATP＋H2O＝ADP＋Pi。
磷酸解（作用）（phosphorolysis）:在分子內通過(guò)引入一個(gè)無(wú)機磷酸形成磷酸酯鍵而使原來(lái)鍵斷裂的方式。實(shí)際上引入了一個(gè)磷?；?。
半乳糖血癥（galactosemia）:人類(lèi)的一種基因型遺傳代謝缺陷，特點(diǎn)是由于缺乏1-磷酸半乳糖尿苷酰轉移酶導致嬰兒不能代謝奶汁中乳糖分解生成的半乳糖。
尾部生長(cháng)（tailward growth）:一種聚合反應機理，經(jīng)過(guò)活化的單體的頭部結到聚合物的尾部，連接到聚合物尾部的單體的尾部又成了接收下一個(gè)單體的受體。
氧化磷酸化(oxidative phosphorylation)：電子從一個(gè)底物傳遞給分子氧的氧化與酶催化的由ADP和Pi生成ATP的磷酸化相偶聯(lián)的過(guò)程。
化學(xué)滲透理論(chemiosmotic theory)：一種學(xué)說(shuō)，主要論點(diǎn)是底物氧化期間建立的質(zhì)子濃度梯度提供了驅動(dòng)由ADP和Pi形成ATP的能量。
解偶聯(lián)劑（uncoupling agent）:一種使電子傳遞與ADP磷酸化之間的緊密偶聯(lián)關(guān)系解除的化合物，例如2,4-二硝基苯酚。
P/O比(P/O ratio)：在氧化磷酸化中，每1/2O2被還原時(shí)形成的ATP的摩爾數。電子從NADH傳遞給O2時(shí)，P/O比為3，而電子從FADH2傳遞給O2時(shí)，P/O比為2。
高能化合物(high energy compound)：在標準條件下水解時(shí)自由能大幅度減少的化合物。一般是指水解釋放的能量能驅動(dòng)ADP磷酸化合成ATP的化合物。
葉綠體（chloroplast）：藻類(lèi)和植物中含有葉綠素進(jìn)行光合作用的器官。
葉綠素（chlorophyll）：光合作用膜中的綠色色素，它是光合生物中主要的捕獲光的成分。
輔助色素（accessory pigments）:在植物和光合細菌中象類(lèi)胡蘿卜素、葉黃素和藻膽（色）素那樣吸收可見(jiàn)光的色素，這類(lèi)色素是對葉綠素捕獲光能的補充。
光合作用(photosynthesis)：綠色植物或光合細菌利用光能將CO2轉化成有機化合物的過(guò)程。
光合磷酸化(photophosphorylation)：在葉綠體ATP合成酶催化下依賴(lài)于光的由ADP和Pi合成ATP的過(guò)程。
光反應(light reactions)：光合色素將光能轉變成化學(xué)能并形成ATP和NADPH的過(guò)程。
暗反應(dark reactions)：利用光反應生成的ATP和NADPH的化學(xué)能使CO2還原成糖或其它有機物的一系列酶促過(guò)程。
Calvin 循環(huán)（Cavin cycle）:也稱(chēng)之還原戊糖磷酸循環(huán)（RPP cycle: reductive pentose phosphate cycle），C3途徑（C3 pathway）。在光合作用期間，將CO2還原轉化為糖的反應循環(huán)。是植物用于固定二氧化碳生成磷酸丙糖的循環(huán)途徑。
C4途徑（C4 pathway）：一些植物中固定碳的途徑，其特點(diǎn)是通過(guò)使CO2濃縮減少光呼吸。在該途徑中，在葉肉細胞CO2被整合到C4酸中，然后C4酸在維管束鞘細胞被脫羧，釋放出的CO2被Calvin 循環(huán)利用。
光呼吸（photorespiration）：植物依賴(lài)光攝取氧進(jìn)行磷酸乙醇酸代謝的過(guò)程。光呼吸之所以發(fā)生是由于O2可以與CO2競爭核酮糖-1,5-二磷酸羧化氧化酶的活性部位。
β氧化途徑(βoxidation pathway)：是脂肪酸氧化分解的主要途徑，脂肪酸被連續地在β碳氧化降解生成乙酰CoA，同時(shí)生成NADH和FADH2，因此可產(chǎn)生大量的ATP。 該途徑因脫氫和裂解均發(fā)生在β位碳原子而得名。每一輪脂肪酸β氧化都是由4步反應組成：氧化、水化、再氧化和硫解。
肉毒堿穿梭系統（carnitine shuttle system）:脂酰CoA通過(guò)形成脂酰肉毒堿從細胞質(zhì)轉運到線(xiàn)粒體的一個(gè)穿梭循環(huán)途徑。
酮體(acetone body)：在肝臟中由乙酰CoA合成的燃料分子（β羥基丁酸、乙酰乙酸和丙酮）。在饑餓期間酮體是包括腦在內的許多組織的燃料，酮體過(guò)多將導致中毒。
檸檬酸轉運系統（citrate transport system）:將乙酰CoA從線(xiàn)粒體轉運到細胞質(zhì)的穿梭循環(huán)途徑。在轉運乙酰CoA的同時(shí)，細胞質(zhì)中的NADH氧化成NAD＋、NADP＋還原為NADPH。每循環(huán)一次消耗2分子ATP。
?；d體蛋白（ACP, acyl carrier protein）：通過(guò)硫酯鍵結合脂肪酸合成的中間代謝物的蛋白質(zhì)（原核生物）或蛋白質(zhì)的結構域（真核生物）。
生物固氮作用(Biological nitrogen fixation)：大氣中的氮被還原為氨的過(guò)程。生物固氮只發(fā)生在少數的細菌和藻類(lèi)中。
尿素循環(huán)（urea cycle）:是一個(gè)由4步酶促反應組成的可以將來(lái)自氨和天冬氨酸的氮轉化為尿素的代謝循環(huán)。該循環(huán)是發(fā)生在脊椎動(dòng)物肝臟中的一個(gè)代謝循環(huán)。
脫氨(deamination)：在酶的催化下從生物分子（氨基酸或核苷酸分子）中除去氨基的過(guò)程。
氧化脫氨（oxidative deamination）：α-氨基酸在酶的催化下脫氨生成相應α-酮酸的過(guò)程。氧化脫氨過(guò)程實(shí)際上包括脫氫和水解兩個(gè)步驟。
轉氨酶（transaminases）：也稱(chēng)之氨基轉移酶（aminotransferases）。催化一個(gè)α-氨基酸的α-氨基向一個(gè)α-酮酸轉移的酶。
轉氨(transamination)：一個(gè)α-氨基酸的α-氨基借助轉氨酶的催化作用轉移到一個(gè)α-酮酸的過(guò)程。
乒乓反應（ping-pong reaction）：在該反應中，酶結合一個(gè)底物并釋放出一個(gè)產(chǎn)物，留下一個(gè)取代酶，然后該取代酶再結合第二個(gè)底物和釋放出第二個(gè)產(chǎn)物，最后酶恢復到它的起始狀態(tài)。
生糖氨基酸(glucogenic amino acids)：那些降解能生成可作為糖異生前體分子，例如丙酮酸或檸檬酸循環(huán)中間代謝物的氨基酸。
生酮氨基酸(acetonegenic amino acid)：那些降解可生成乙酰CoA或酮體的氨基酸。
苯酮尿癥（phenylketonuria）:是由于苯丙氨酸羥化酶缺乏引起苯丙酮酸堆積的代謝遺傳病。缺乏苯丙氨酸羥化酶，苯丙氨酸只能靠轉氨生成苯丙酮酸，病人尿中排出大量苯丙酮酸。苯丙酮酸堆積對神經(jīng)有毒害，智力發(fā)育出現障礙。
尿黑酸癥（alcaptonuria）:是酪氨酸代謝中缺乏尿黑酸氧化酶引起的代謝遺傳病。這種病人尿中含有尿黑酸，在堿性條件下暴露于氧氣氧化并聚合為類(lèi)似于黑色素的物質(zhì)，從而使尿成黑色。
核苷磷酸化酶(nucleoside phosphorylase)：能分解核苷生成含氮堿和戊糖的磷酸酯的酶。
核苷水解酶(nucleoside hydrolase)：能分解核苷生成含氮堿和戊糖的酶。
從頭合成(de novo synthesis )：生物體內用簡(jiǎn)單的前體物質(zhì)合成生物分子的途徑，例如核苷酸的從頭合成。
補救途徑(salvage pathway)：與從頭合成途徑不同，生物分子的合成，例如核苷酸可以由該類(lèi)分子降解形成的中間代謝物，如堿基等來(lái)合成，該途徑是一個(gè)再循環(huán)途徑。
痛風(fēng)（gout）：是尿酸過(guò)量生產(chǎn)或尿酸排泄不充分引起的尿酸堆積造成的，尿酸結晶堆積在軟骨、軟組織、腎臟以及關(guān)節處。在關(guān)節處的沉積會(huì )造成劇烈的疼痛。
別嘌呤醇（allopurinol）：是結構上（嘌呤環(huán)上第7位是C，第8位是N）類(lèi)似于次黃嘌呤的化合物，對黃嘌呤氧化酶有很強抑制作用，常用來(lái)治療痛風(fēng)。
自殺抑制作用（suicide substrate）：底物類(lèi)似物經(jīng)酶催化生成的產(chǎn)物變成了該酶的抑制劑。例如別嘌呤醇對黃嘌呤氧化酶的抑制就屬于這種抑制類(lèi)型。
Lesch-Nyhan綜合癥（Lesch-Nyhan ）：也稱(chēng)之自毀容貌癥，是由于次黃嘌呤-鳥(niǎo)嘌呤磷酸核糖轉移酶的遺傳缺陷引起的。缺乏該酶使得次黃嘌呤和鳥(niǎo)嘌呤不能轉換為IMP和GMP，而是降解為尿酸，過(guò)量尿酸將導致Lesch-Nyhan綜合癥。
激素（hormone）：一類(lèi)由內分泌組織合成的微量的化學(xué)物質(zhì)，它由血液運輸到靶組織，起著(zhù)一個(gè)信使的作用調節靶組織（器官）的功能。
激素受體（hormone receptor）：位于細胞表面或細胞內結合特異激素并引發(fā)細胞響應的蛋白質(zhì)。
第二信使(second messenger)：響應外部信號（第一信使），例如激素而在細胞內合成的效應分子，例如cAMP、肌醇三磷酸或二?；视偷?。第二信使再去調節靶酶，引起細胞內各種效應。
級聯(lián)放大(cascade)：在體內的不同部位，通過(guò)一系列的酶促反應來(lái)傳遞一個(gè)信息，并且初始信息在傳到系列反應的最后時(shí)，信號得到放大，這樣的一個(gè)系列叫做級聯(lián)系統。最普通的類(lèi)型是蛋白水解和蛋白質(zhì)磷酸化的級聯(lián)放大。
G蛋白(G proteins)：在細胞內信號傳導途徑中起著(zhù)重要作用的GTP結合蛋白質(zhì)，由α、β、γ三個(gè)不同亞基組成。與激素受體結合的配體誘導GTP與G蛋白結合的GDP進(jìn)行交換，結果激活位于信號傳導途徑中下游的腺苷酸環(huán)化酶。G蛋白將胞外的第一信使腎上腺素等激素和胞內的腺苷酸環(huán)化酶催化的腺苷酸環(huán)化生成的第二信使cAMP聯(lián)系起來(lái)。G蛋白具有內源GTP酶活性。
激素效應元件（hormone response elements, HRE）：是指類(lèi)固醇、甲狀腺素等激素受體結合的一段短的DNA序列（12～20bp），這類(lèi)受體結合DNA后可改變相鄰基因的表達。
半保留復制(semiconservative replication)：DNA復制的一種方式。每條鏈都可用作合成互補鏈的模板，合成出兩分子的雙鏈DNA，每個(gè)分子都是由一條親代鏈和一條新合成的鏈組成。
復制叉（replication forks）：Y字型結構，在復制叉處作為模板的雙鏈DNA解旋，同時(shí)合成新的DNA鏈。
DNA聚合酶（DNA polymerase）：以 DNA為模板催化核苷酸殘基加到已存在的聚核苷酸的3ˊ末端反應的酶。某些DNA聚合酶具有外切核酸酶的活性，可用來(lái)校正新合成的核苷酸序列。
單鏈結合蛋白（SSB，single-strand binding protein）:一種與單鏈DNA結合緊密的蛋白質(zhì)，它的結合可以防止復制叉處的單鏈DNA本身重新折疊回雙鏈區。
滾環(huán)復制（rolling-circle replication）：復制環(huán)狀DNA的一種模式，在該模式中，DNA聚合酶結合在一個(gè)缺口鏈的3ˊ端，繞環(huán)合成與模板鏈互補的DNA，每一輪都是新合成的DNA取代前一輪合成的DNA。
逆轉錄酶（reverse transcriptase）:一種催化以RNA為模板合成DNA的DNA聚合酶，具有RNA指導的DNA合成、水解RNA和DNA指導的DNA合成的酶活性。
互補DNA (cDNA , complementary DNA)：通過(guò)逆轉錄酶由mRNA模板合成的雙鏈DNA。
聚合酶鏈式反應（PCR, polymerase chain reaction）:擴增樣品中的DNA量和富集眾多DNA分子中的一個(gè)特定DNA序列的一種技術(shù)。在該反應中，使用與目的DNA序列互補的寡核苷酸作為引物，進(jìn)行多輪的DNA合成。其中包括DNA變性、引物退火和在Taq DNA聚合酶催化下的DNA合成。
直接修復（direct repair）:是通過(guò)一種可連續掃描DNA，識別出損傷部位的蛋白質(zhì)將損傷部位直接修復的方法。該修復方法不用切斷DNA或切除堿基。
切除修復（excision repair）:通過(guò)切除-修復內切酶使DNA損傷消除的修復方法。一般是切去損傷區，然后在DNA聚合酶的作用下以露出的單鏈為模板合成新的互補鏈，最后用連接酶將缺口連接起來(lái)。
錯配修復（mismatch repair）:在含有錯配堿基的DNA分子中使正常核苷酸序列恢復的修復方式。這種修復方式的特點(diǎn)是：識別出正確的鏈，切除掉不正確鏈的部分，然后通過(guò)DNA聚合酶和DNA連接酶的作用合成正確配對的雙鏈DNA。
遺傳學(xué)中心法則（genetic central dogma）:描述從一個(gè)基因到相應蛋白質(zhì)的信息流的途徑。遺傳信息貯存在DNA中，DNA被復制傳給子代細胞，信息被拷貝或由DNA被轉錄成RNA，然后RNA被翻譯成多肽鏈。不過(guò)由于逆轉錄酶的發(fā)現，也可以以RNA為模板合成DNA。
轉錄（transcription）:在由RNA聚合酶和輔助因子組成的轉錄復合體的催化下，從雙鏈DNA分子中拷貝生物信息生成單一一條RNA鏈的過(guò)程。
模板鏈(template strand)：可作為模板轉錄為RNA的那條鏈，該鏈與轉錄的RNA堿基互補（A-U, G-C）。在轉錄過(guò)程中，RNA聚合酶與模板鏈結合，并沿著(zhù)模板鏈的3ˊ→5ˊ方向移動(dòng)，按照5ˊ→3ˊ方向催化RNA的合成。
編碼鏈（coding strand）：雙鏈DNA中，不能進(jìn)行轉錄的那條DNA鏈,該鏈的核苷酸序列與轉錄生成的RNA的序列一致（在RNA中是以U取代了DNA中的T）。
核心酶(core enzyme)：大腸桿菌的RNA聚合酶全酶由五個(gè)亞基（α2ββ'δ）組成，沒(méi)有δ亞基的酶叫核心酶。核心酶只能使已開(kāi)始合成的RNA鏈延長(cháng)，但不具有起始合成RNA的能力，必需加入δ亞基才表現出全部聚合酶的活性。
RNA聚合酶(RNA polymerase)：以一條DNA鏈或RNA為模板催化由核苷-5ˊ-三磷酸合成RNA的酶。
啟動(dòng)子（promoter）:DNA分子中RNA聚合酶能夠結合并導致轉錄起始的序列。
內含子（introns）：在轉錄后的加工中，從最初的轉錄產(chǎn)物除去的內部的核苷酸序列。術(shù)語(yǔ)內含子也指編碼相應RNA內含子的DNA中的區域。
外顯子（exons）：既存在于最初的轉錄產(chǎn)物中，也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。術(shù)語(yǔ)外顯子也指編碼相應RNA外顯子的DNA中的區域。
終止因子(termination factors)：協(xié)助RNA 聚合酶識別終止信號的輔助因子（蛋白質(zhì)）。
核酶（ribozymes）：具有象酶那樣催化功能的RNA分子。
剪接體（spliceosome）: 大的蛋白質(zhì)-RNA復合體，它催化內含子從mRNA前體中除去的反應。
RNA加工過(guò)程（RNA processing）：將一個(gè)RNA原初轉錄產(chǎn)物轉換成成熟RNA分子的反應過(guò)程。加工包括從原初轉錄產(chǎn)物中刪除一些核苷酸，添加一些基因沒(méi)有編碼的核苷酸，和對某些堿基進(jìn)行共價(jià)修飾。
遺傳密碼（genetic code）:核酸中的核苷酸殘基序列與蛋白質(zhì)中的氨基酸殘基序列之間的對應關(guān)系。連續的3個(gè)核苷酸殘基序列為一個(gè)密碼，特指一個(gè)氨基酸。標準的遺傳密碼是由64個(gè)密碼組成的，幾乎為所有生物通用。
起始密碼（iniation codon）：指定蛋白質(zhì)合成起始位點(diǎn)的密碼。最常見(jiàn)的起始密碼是蛋氨酸密碼：AUG。
終止密碼（termination codon）：任何tRNA分子都不能正常識別的、但可被特殊蛋白結合并引起新合成的肽鏈從翻譯機器上釋放的密碼。存在三個(gè)終止密碼：UAG，UAA和UGA。
密碼子(codon)：mRNA（或DNA）上的三聯(lián)體核苷酸殘基序列，該序列編碼著(zhù)一個(gè)指定的氨基酸，tRNA的反密碼子與mRNA的密碼子互補。
反密碼子（anticodon）: tRNA分子的反密碼環(huán)上的三聯(lián)體核苷酸殘基序列。在翻譯期間，反密碼與mRNA中的互補密碼結合。
簡(jiǎn)并密碼子(degenerate codon)：也稱(chēng)之同義密碼子（synonymous codon）。是指編碼相同氨基酸的幾個(gè)不同的密碼子。
氨基酸臂（amino arm）:也稱(chēng)之接納莖（acceptor stem）。tRNA分子中靠近3ˊ端的核苷酸序列和5ˊ端的序列堿基配對，形成的可接收氨基酸的臂（莖）。
TψC臂（TψC arm）：tRNA中含有胸腺嘧啶核苷酸-假尿嘧啶核苷酸-胞嘧啶核苷酸殘基序列的莖環(huán)結構。
氨酰-tRNA（aminoacyl-tRNA）：在氨基酸臂的3ˊ端的腺苷酸殘基共價(jià)連接了氨基酸的tRNA分子。
同工tRNA（isoacceptor tRNA）：結合相同氨基酸的不同的tRNA分子。
擺動(dòng)(wobble) ：處于密碼子3ˊ端的堿基和與之互補的反密碼的5ˊ端的堿基之間的堿基配對有一定的寬容性，即處于反密碼的5ˊ端的堿基（也稱(chēng)之擺動(dòng)位置），例如I可以與密碼子上3ˊ端的U、C和A配對。由于存在擺動(dòng)現象所以使得一個(gè)tRNA反密碼子可以和一個(gè)以上的mRNA密碼子結合。
氨酰-tRNA合成酶（aminoacyl-tRNA synthetase）：催化特定氨基酸激活并共價(jià)結合在相應的tRNA分子3ˊ端的酶。
翻譯起始復合體（translation initiation complex）：由核糖體亞基、一個(gè)mRNA模板、一個(gè)起始的tRNA分子和起始因子組成并組裝在蛋白質(zhì)合成起始點(diǎn)的復合體。
讀碼框( reading frame)：代表一個(gè)氨基酸序列的mRNA分子的非重疊密碼序列。一個(gè)mRNA的讀碼框是由轉錄起始位置（通常是AUG密碼）確定的。
SD序列（Shine-Dalgarno sequence）：mRNA中用于結合原核生物核糖體的序列。
肽酰轉移酶（peptidyl transferase）：蛋白質(zhì)合成期間負責轉移肽?；痛呋逆I形成的酶。
嘌呤霉素（puromycin）：通過(guò)整合到生長(cháng)著(zhù)的肽鏈，引起肽鏈合成提前終止來(lái)抑制多肽鏈合成的一種抗生素。
開(kāi)放讀碼框(open reading frame)：DNA 或RNA序列中一段不含終止密碼的連續的非重疊核苷酸密碼。
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