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雙向電泳實(shí)驗 雙向電泳實(shí)驗過(guò)程及相關(guān)溶液配置(經(jīng)典)

雙向電泳實(shí)驗 雙向電泳實(shí)驗過(guò)程及相關(guān)溶液配置(經(jīng)典)


3.2點(diǎn)樣,上膠
分兩次吸取樣品,每次170ul,按從正極到負極的順序加入點(diǎn)樣槽兩側,再用鑷子撥開(kāi)Immobiline DryStrip gels(18cm,pH 3-10)膠條,從正極到負極將膠條壓入槽中,膠面接觸加入的樣品雙向電泳實(shí)驗過(guò)程及相關(guān)溶液配置
A.實(shí)驗過(guò)程
一、實(shí)驗原理:2-DE的第一向電泳等電聚焦是基于等電點(diǎn)不同而將蛋白粗步分離,第二向SDS-PAGE是基于蛋白質(zhì)分子量不同,而將一向分離后的蛋白進(jìn)一步分離這樣就可以得到蛋白質(zhì)等電點(diǎn)和分子量的信息
二、實(shí)驗步驟:
1.樣品的溶解
取純化后的晶體蛋白3.0mg,加入300ul裂解液(1mg蛋白:100ul裂解液)振蕩器上振蕩10min左右,共處理一個(gè)小時(shí)其中每隔10~15分鐘振蕩一次,然后13200rpm離心15min除雜質(zhì),取上清分裝,每管70ul,-80oC保存
2.Bradford法測蛋白含量
取0.001g BSA(牛血清白蛋白)用1ml超純水溶解,測定BSA標準曲線(xiàn)及樣品蛋白含量
取7個(gè)10ml的離心管,首先在5個(gè)離心管中按次序加入0ul,5ul,10ul,15ul,20ul的BSA溶解液,另2管中分別加入2ul的待測樣品溶液,再在每管中加入相應體積的雙蒸水(總體積為80ul),然后,各管中分別加入4ml的Bradford液(原來(lái)配好的Bradford液使用前需再取需要的劑量過(guò)濾一遍方能使用),搖勻,2min在595nm下,按由低到高的濃度順序測定各濃度BSA的OD值,再測樣品OD值(測量過(guò)程要在一個(gè)小時(shí)內完成)例如:
編號蛋白量(ul)Buffer(ul)Bradford(ml)OD595值
1 080 40 25 75 40.024 310 70 40.061 415 65 40.091 520 60 40.116 Bt4 278 40.079 Bt4 476 4
轉Bt4 278 40.075
轉Bt4 476 4
標準曲線(xiàn)方程式:Y=aX b.其中Y為OD值,X為蛋白含量a、b通過(guò)作圖輸入數據可知
相關(guān)系數通過(guò)輸入數據,作圖,軟件分析可得
OD值測量過(guò)程:
比色皿用70%的乙醇保存,待用時(shí)用雙蒸水沖洗,再用無(wú)水乙醇沖洗,雙蒸水沖洗,再加入待測樣品溶液潤洗,然后,加入樣品,測定OD值
3.雙向電泳第一向---IEF(雙向電泳中一律使用超純水)
3.1水化液的制備
稱(chēng)取2.0mg的DTT,用700ul水化液儲液溶解后,加入8ul 0.05%的溴酚蘭,3.5ul(0.5%v/v)IPG buffer(pH 3-10)振蕩混勻,13200rpm離心15min除雜質(zhì),取上清
在含300ug蛋白(經(jīng)驗值)的樣品溶解液中加入水化液,至終體積為340ul,振蕩器上振蕩混合,13200rpm離心15min除雜質(zhì),取上清注意:膠條使用前,要在室溫中平衡30分鐘;加樣時(shí),正極要多加樣,以防氣泡的產(chǎn)生;壓膠時(shí)不能產(chǎn)生氣泡;酸性端對應正極,堿性端對應負極;樣品加好后,加同樣多的覆蓋油(Bio-Rad),兩個(gè)上樣槽必須與底線(xiàn)齊平
3.3 IPG聚焦系統跑膠程序的設定(跑膠溫度為20oC)
S1(30v,12hr,360vhs,step)
S2(500v,1hr,500vhs,step)
S3(1000v,1hr,1000vhs,step)
S4(8000v,0.5hr,2250vhs,Grad)
S5(8000v,5hr,40000vhs,step)共計44110vhs,19.5小時(shí)
其中S1用于泡脹水化膠條,S2和S3用于去小離子,S4和S5用于聚焦
3.4平衡
用鑷子夾出膠條,超純水沖洗后,在濾紙上吸干(膠面,即接觸樣品那一面不能接觸濾紙,如果為18cm的膠條要將兩頭剪去),再以超純水沖洗,濾紙吸
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