生物信息學(xué)常用基本詞匯表(轉載)C
C ( Cytosine)
胞嘧啶
作為堿基的兩種嘧啶中的一種。
CAAT box
CAAT 盒
大多數真核啟動(dòng)子具有的一段短序列，其片段模式為 C-A-A-T ， 通常出現在 轉錄起始位點(diǎn)上游 80 個(gè) 核苷酸的地方。許多因子可以與CAAT盒結合 。
carboxy terminus
羧基端
在多肽鏈中，含有羧酸基團 ( —COOH) 的分子端，對應于基因的 3' - 端。
cDNA （ Complementary DNA ）
cDNA ( 互補 DNA)
通過(guò)逆轉錄酶從 RNA 模板合成的 DNA 。
cDNA library
cDNA 文庫
從 mRNA 序列中產(chǎn)生的所有 DNA 序列的集合。這種類(lèi)型的文庫只包含編碼蛋白質(zhì)的 DNA （基因）。
central dogma
中心法則
從基因的核酸序列中提取信息并以此合成蛋白質(zhì)的過(guò)程（ DNA ? RNA ? protein ） 。
character
特征
在 系統發(fā)生樹(shù)中 ， 具有有限狀態(tài)數的特征。
charged amino acid
帶電氨基酸
在一定的生物 pH 值下，帶有正電或負電的氨基酸。
chromatin
染色質(zhì)
在真核生物細胞核內部由大量 DNA 以及與此相關(guān)的組蛋白組成的近似均勻混合物。
chromosome
染色體
在原核生物，包含一個(gè)細胞基因組的DNA分子稱(chēng)為染色體。在真核生物中，與蛋白質(zhì)復合在一起、包含大量遺傳信息的線(xiàn)型DNA分子。
clone
克隆
無(wú)性繁殖，如生物體克隆、基因克隆等。
cloning
克隆
在類(lèi)染色體載體中插入特定的 DNA 一段，使得它們可以在活細胞中得以保存并復制。
Coding sequence
編碼序列
DNA 序列中為蛋白質(zhì)編碼的部分。
Codon
密碼子
基因編碼部分的三核苷酸組合，對應于一個(gè)特定的氨基酸。
Complementary
互補的
（ 1 ）通過(guò)氫鍵連接的核苷酸對（ G 和 C; A 和 T; A 和 U ） ；（ 2 ）核苷酸鏈的反向平行對。
Computational Molecular Biology
計算分子生物學(xué)
主要研究分子生物學(xué)數據的分析方法，開(kāi)發(fā)分析工具。
conformation
構象
蛋白質(zhì)的空間構象。
consensus sequence
一致序列
在兩個(gè)或多個(gè)同源序列的每一個(gè)位置上多數出現的核苷酸或氨基酸組成的序列
conserved sequence
保守序列
在進(jìn)化過(guò)程中基本保持不變的核酸與蛋白質(zhì)序列，它們往往與特定的功能相對應。
Contig
連續交疊群
基因組測序過(guò)程中將許多短的序列片段鏈接成很長(cháng)的連續片段。
convergent evolution
趨同進(jìn)化
指相似基因型或表型性狀的獨立進(jìn)化。例如 ， 眼睛在各種生物體 （ 如哺乳動(dòng)物、軟體動(dòng)物以及昆蟲(chóng) ） 中獨立進(jìn)化 ， 結構各異。
core fold
核心折疊
構成蛋白質(zhì)空間形狀的基本模式。
CpG island
CpG 島
在 哺乳類(lèi)動(dòng)物基因組中的一個(gè) 500bp 到 3000bp 的區域 ， 該區域中的二核苷酸 CpG 的含量比其他區域的正常水平要高。通常，與此相關(guān)的是真核生物管家基因的啟動(dòng)子區域。
crystal
晶體
由分子的規則排列組成的固體結構。
D
degeneracy
簡(jiǎn)并性
指某些氨基酸可以被一個(gè)以上的三聯(lián)密碼子編碼的特性。
denatured protein
變性蛋白質(zhì)
指蛋白質(zhì)因為受熱作用或者去污劑或尿素等化學(xué)作用而失去了正常的三級結構和四級結構的結果。
deoxyribonucleic acid (DNA)
脫氧核糖核酸 （ DNA ）
由相連的核苷酸組成的雙鏈生物二聚體 ， 其核苷酸含有脫氧糖基。DNA是遺傳的分子基礎。
dipeptide
二肽
由一個(gè)肽鍵連成的兩個(gè)氨基酸。
disulfide bond
二硫鍵
二硫鍵是蛋白質(zhì)中兩個(gè)半胱氨酸側鏈之間形成的化學(xué)鍵 。
DNA
DNA
參見(jiàn) 脫氧核糖核酸。
domain
域（結構域）
指蛋白質(zhì)結構中相對獨立的、具有特定功能的空間區域。
dot plot
點(diǎn)陣圖
對兩條序列進(jìn)行圖形化比較的方法。圖形中的一系列的斜線(xiàn)對應于序列相似的區域。
dynamic programming
動(dòng)態(tài)規劃
一種可以有效地探求一定復雜問(wèn)題的各種可能的解決方案的程序；它將一個(gè)問(wèn)題合理分解成一些小的子問(wèn)題，然后利用部分計算解得到最終答案。
生物信息學(xué)常用基本詞匯表(轉載)A
英 文 名 詞
中 文 名 詞
解 釋
A （ Adenine ）
腺嘌呤
作為堿基的兩種嘌呤中的一種。
active site
活化位點(diǎn)
蛋白質(zhì)三維表面催化作用發(fā)生的區域。
alignment
比對
為了確定兩個(gè)同源核酸或蛋白質(zhì)序列的累計差異而進(jìn)行的配對稱(chēng)為比對。
alignment of alignments
比對的比對
即比對的對象不是簡(jiǎn)單的序列，而是序列的比對。
alleles
等位基因
一個(gè)基因的不同版本。
alpha carbon
α 碳
在氨基酸中與側鏈（ R- 基團）相連的中心碳原子。
alternative splicing
可變剪接
從一個(gè)單獨的 hnRNA 生成兩個(gè)或多個(gè) mRNA 分子的過(guò)程。
amino terminus (N-terminal)
氨基端（ N 端）
在一個(gè)多肽中，具有自由氨基的分子端，對應于基因的 5'- 端。
anti-parallel
反向平行
表示相反的方向；在雙鏈DNA中，這意味著(zhù)如果一條鏈是 5' 到 3' 的，則其互補鏈 方向 是 3' 到 5' 的。
B
base pair
堿基對
（1）在雙鏈DNA中嘌呤和嘧啶之間的相互作用（特別指A和T之間，G和C之間）；（2）雙鏈DNA序列長(cháng)度的基本單位。
beta turns
β轉角
在反向平行的β折疊片中，當β鏈反轉方向的時(shí)候蛋白質(zhì)內部形成的U型結構
Bioinformatics
生物信息學(xué)
應用信息科學(xué)的理論、方法和技術(shù)，管理、分析和利用生物分子數據。
Biocomputing
生物計算
本書(shū)中特指用計算機技術(shù)分析和處理生物分子數據。
Basic Local Alignment Search Tool ( Blast)
基本的局部比對搜索工具（ Blast ）
一種常用的序列數據庫搜索工具。
blotting and hybridization
印跡和雜交
將分子（通常是核酸分子）從 凝膠轉移到膜上，接著(zhù)用綁定有特定感興趣的分子的標記探針進(jìn)行洗脫的過(guò)程。
bootstrap test
自舉檢驗
對 置信程度進(jìn)行量化的檢驗。
branch and bound method
分支約束法
一種空間搜索方法，通過(guò)約束條件減少搜索空間，提高搜索效率。
branches
分支
在 系統發(fā)生樹(shù)中，通過(guò)分支連接兩個(gè)節點(diǎn)。
