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在很久很久以前,年輕的Piotr Chomczynski老爺爺和Nicoletta Sacchi老奶奶在美國NIH大院里相遇,互相感慨科研經(jīng)費不好拿啊,儀器設備都貴啊,咱得省著(zhù)點(diǎn)花錢(qián)啊,于是兩人一合計,發(fā)明了簡(jiǎn)單便宜的TRizol抽提RNA的方法(Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction. 1987. Analytical Biochemistry)。正是因為他們的發(fā)明讓RNA抽提迅速簡(jiǎn)便,從此開(kāi)啟了RNA研究的熱潮。
Nature Protocols曾高度評價(jià)這個(gè)偉大發(fā)明“大大加快了RNA相關(guān)研究的進(jìn)程,并使non-coding RNAs的發(fā)現成為可能”。
現在我們所熟知的TRIzol是Life Technologies公司的商品名,而同樣的試劑在Piotr Chomczynski老爺爺創(chuàng )辦的MRC公司則被命名為RNAzol(據Piotr Chomczynski老爺爺自己透露,他們已經(jīng)將RNAzol改進(jìn),使抽提得到的RNA無(wú)基因組DNA殘留)。事實(shí)上,這種RNA抽提的方法應該叫做“異硫氰酸胍-酚-氯仿抽提法”。
TRIzol作用原理:
在勻質(zhì)化或溶解樣品中,TRIzol試劑可保持RNA的完整性,同時(shí)能破壞細胞及溶解細胞成分。加入氯仿離心后,裂解液分離成水相和有機相。RNA存在于水相。水相轉移后,RNA通過(guò)異丙醇沉淀回收。移去水相后,用乙醇沉淀可從中間相得到DNA,加入異丙醇沉淀可從有機相得到蛋白質(zhì)。
需自備的耗材試劑:
RNase free的一次性帶蓋透明聚丙烯管(比如AXYGEN的1.5ml EP管,RNase free的,可以拆包即用。話(huà)說(shuō),我要不要問(wèn)AXYGEN收廣告費啊╮(╯▽╰)╭?)
RNase free的槍頭(比如AXYGEN的RNase free的槍頭,有盒裝的和袋裝的,拆包即用)
RNase free玻璃瓶:玻璃瓶200°C烘烤2h即可去除RNase,塑料瓶蓋可浸泡10分鐘的0.5 M NaOH溶液,然后用RNase free水徹底沖洗,并高壓蒸汽滅菌。
氯仿(國產(chǎn)分析純的即可,比如國藥集團產(chǎn)的)
異丙醇(國產(chǎn)分析純的即可)
RNase free水:即DEPC treated水。把水加入RNase-free玻璃瓶中,加入0.1%(v/v)DEPC用力搖勻,37°C過(guò)夜,高溫高壓滅菌。滅菌時(shí)瓶口需擰松,DEPC受高溫會(huì )分解出大量CO2,注意安全!
75%乙醇(無(wú)水乙醇溶于RNase free水中)
簡(jiǎn)明抽提流程:
裂解
a) 新鮮取材的組織液氮急凍后,每 50-100mg組織加1ml TRIzol,使用強力勻漿機勻漿;
b) 貼壁細胞則棄培養基后每87.5px皿中加入TRIzol試劑1ml吹打裂解;
c) 懸浮細胞則離心沉淀細胞棄培養基,每5-10×106個(gè)細胞中加入1ml TRIzol吹打裂解。
Tips:使用TRIzol試劑前避免洗滌組織和細胞,因為這增加了mRNA降解的可能性。
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室溫孵育5-10min
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每1ml TRIzol中加200ul氯仿,用手大力搖管15s,
室溫孵育2-3min
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2-8°C、12000 g×15min
離心后,混合物分離為下層紅色的酚-氯仿相、中間相以及上層無(wú)色水相。RNA存在于水相。
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轉移水相到一個(gè)新管,加入500ul異丙醇上下顛倒混勻,室溫孵育10min
Tips:轉移水相時(shí),槍尖隨著(zhù)液面下移而下移,避免擾亂分層,慢慢吸取,避免吸到中間相和下層有機相,更不要貪心吸太多,吸大約400ul就好。
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2-8°C、12000 g×10min
往往離心前RNA不可見(jiàn),離心后再管側面和底部形成白色沉淀
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棄上清,1ml 75%乙醇洗滌一次,2-8°C、7500 g×5min
Tips:加入75%乙醇時(shí)輕輕加進(jìn)去就好,盡量不要把RNA沉淀吹散,把沉淀保持在原位最好了,因為有時(shí)候RNA太少,吹散了再離心下來(lái)時(shí)RNA碎片不一定能聚集到一起形成肉眼可見(jiàn)的沉淀,導致后面的“盲操作”。而不小心吹散的話(huà)也沒(méi)關(guān)系,對RNA質(zhì)量不會(huì )有影響。
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盡量吸除上清,室溫干燥5-10min,以RNase free水溶解,并保存于-70°C
Tips:密切注意RNA沉淀的干燥程度,不要完全干燥,這將大大降低其溶解度。部分溶解的RNA其A260/280比值會(huì )偏低。最佳干燥度為RNA沉淀仍然是白色的,微微濕潤呈啫喱狀。
OK,搞定!
附言:貓大一直堅信,只要一直奔跑,那一邊就是天涯海角!小伙伴們,跟貓大一起加油吧?。?!# ̄▽?zhuān)?)
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