之前寫(xiě)過(guò)四篇關(guān)于Zotero技巧的帖子。

* [Zotero（1）：文獻管理軟件Zotero基礎及進(jìn)階示范](http://www.yangzhiping.com/tech/zotero1.html)
* [Zotero（2）：作為知識管理工具的Zotero](http://www.yangzhiping.com/tech/zotero2.html)
* [Zotero（3）：平板與社交：再談研究輔助工具Zotero兼配套APP](http://www.yangzhiping.com/tech/zotero3.html)
* [Zotero（4）：Zotero之Zotfile插件的使用](http://www.yangzhiping.com/tech/zotero4.html)

在找這幾篇舊文的朋友，可以去我的個(gè)人博客看看，存檔在那里：http://t.cn/z8dHbTM 多數技巧還沒(méi)過(guò)時(shí)。今天這篇帖子則側重，如何打造一個(gè)半自動(dòng)化的電子文獻資料管理流程。這篇不講基礎安裝、云同步等技巧，前面帖子已經(jīng)講得夠多了。讓我們開(kāi)干吧，超詳細，眾多技巧匯合，請耐心看。

## 問(wèn)題1：如何快速收藏電子書(shū)或者論文？

假設在豆瓣看了一本好書(shū)，如丹尼特新作【直覺(jué)泵】，網(wǎng)址如下：

* [Intuition Pumps and Other Tools for Thinking (豆瓣)](http://book.douban.com/subject/20437999/)

點(diǎn)擊瀏覽器右上角的Zotero圖標，收藏即可：



好了，打開(kāi)Zotero，我們看到，該書(shū)已經(jīng)保存在這里了。



同樣，對于論文你也可以如此處理，參照老文章，建議多使用[Google Scholar](http://scholar.google.com/)

## 問(wèn)題2：如何標記文獻的重要性？

步驟如下：

1、在丹尼特這本書(shū)的條目這里，創(chuàng )建一個(gè)【重要文獻】類(lèi)似標簽；




2、在界面的左下角，找到【重要文獻】該標簽，然后右鍵，對該標簽指派顏色：



比如紅色，同時(shí)會(huì )指派快捷鍵，如【1】如下圖所示：



3、以上操作只需要執行一次。未來(lái)就很爽了，看到好文獻，直接鍵盤(pán)按【1】就表示喜歡。最多可分配6個(gè)數字。比如，1表示非常重要文獻，2表示比較重要文獻，諸如此類(lèi)。

## 問(wèn)題3：怎么判斷文獻重要性？

我們怎么判斷文獻特別重要呢？有三個(gè)簡(jiǎn)單辦法：

* 作者的重要性：比如【H指數】
* 文獻的引用次數：比如【Google學(xué)術(shù)引用次數】
* 文獻的學(xué)術(shù)社交媒體影響力，比如【altmetric分數】

以前的文章與我最近的微博，都談過(guò)最后一個(gè)辦法【altmetric分數】，這里就不詳細說(shuō)了。只說(shuō)第一個(gè)與第二個(gè)辦法：H指數與Google學(xué)術(shù)引用次數。先說(shuō)第一個(gè)：H指數。

H指數是什么？如果人際關(guān)系混得不錯，在30以上，一般在國內可以拿下學(xué)霸地位。超過(guò)50，鳳毛麟角，屬于普通老百姓要珍惜的大牛級別科學(xué)家。比如，施一公是60。

比如，丹尼特這位作者的H指數可以在這里查詢(xún)：[Daniel C. Dennett - Google Scholar Citations](http://scholar.google.com/citations?user=3FWe5OQAAAAJ&hl=en&oi=ao)

我們發(fā)現他高達68，那么就表示這位作者非常重要：



我們對丹尼特這本書(shū)標記為很重要，那么，選中它，按個(gè)【1】就可以了，效果如下圖所示：



接下來(lái)，我們說(shuō)說(shuō)第二個(gè)簡(jiǎn)單辦法，【Google學(xué)術(shù)引用次數】。當然，你可以去Google學(xué)術(shù)，查看被引次數，然后手動(dòng)添加。比如，丹尼特這本書(shū)被引用9次：



不過(guò)，懶鬼可不是這思路。我們可以借助插件自動(dòng)更新【Google學(xué)術(shù)引用次數】。

因為新讀者可能是第一次接觸Zotero插件安裝，這里多解釋幾句如何安裝插件。

1、打開(kāi)Zotero的【插件】窗口，位置如下所示：



2、然后下載插件，比如該插件的下載地址是：

https://raw.github.com/beloglazov/zotero-scholar-citations/master/builds/zotero-scholar-citations-1.8.4-fx.xpi

3、下載好了，回到Zotero的插件安裝界面，如下圖所示：



安裝好了，如有必要，重啟Zotero即可。

好的，繼續回到丹尼特這本書(shū)。我們點(diǎn)擊右鍵，更新一下引用即可。



問(wèn)題馬上來(lái)了，更新完了，我們看條目的【引用次數】那里還是空的??！老陽(yáng)，這是怎么回事！



別急，這是該插件開(kāi)發(fā)者為了避免將你條目自帶的【引用次數】字段與【Google學(xué)術(shù)引用次數】沖突，所以，他將其保存在【其它】那個(gè)字段里面去了。怎么顯示它？如下圖所示：




勾上它就可以了。我們再重新看一下界面，哇，【Google學(xué)術(shù)引用次數】真的有了！如下圖所示：



丹尼特大神這本書(shū)因為才出版沒(méi)多久，所以才被引9次。而另一位大神2004年出版的Culture, leadership, and organizations，因為屬于某個(gè)流派開(kāi)山之作，被引用了3281次。

因為zotero-scholar-citations這個(gè)插件是可以批量更新【Google學(xué)術(shù)引用次數】的。如此一來(lái)，我們標記論文、圖書(shū)重要性，就更容易了。不過(guò)需要特別注意的是，Google學(xué)術(shù)本身為了防止機器人，做了限制，你一次別更新太多文獻了，那樣，將彈出一個(gè)窗口，Google需要你填入驗證碼，確定你不是機器人，才能繼續更新。

## 問(wèn)題4：怎樣查找英文原版電子書(shū)？

說(shuō)一下怎么查找英文原版書(shū)。

1、電子書(shū)檢索：http://t.cn/zY3Vmkp

這幾個(gè)網(wǎng)站可檢索到70%網(wǎng)上曾出現過(guò)的；

2、私有數據庫：如果是心理學(xué)，推薦APA的psycinfo數據庫與MIT的cognet數據庫，新書(shū)多半可查到；

3、國家圖書(shū)館的英文新書(shū)非常齊全，多半可復印到，同時(shí)可輔以各高校藏書(shū)；

4、亞馬遜，尤其是kindle直接購買(mǎi)電子書(shū)。

## 問(wèn)題5：如何保存電子書(shū)？

好的，丹尼特這本書(shū)，我們假設已經(jīng)查到了電子書(shū)。但是，從網(wǎng)上下載的電子書(shū)，命名亂七八糟，不一定符合你的規律，同時(shí)，能否自動(dòng)將下載的電子書(shū)導入到Zotero庫中？

有，這就是我之前在：[Zotero（4）：Zotero之Zotfile插件的使用](http://www.yangzhiping.com/tech/zotero4.html) 中介紹過(guò)的Zotfile插件。

安裝辦法仍然同上一個(gè)插件一樣，我們在它的官網(wǎng)找到插件下載：

http://www.jlegewie.com/zotfile.html

假設，我們平時(shí)從網(wǎng)上下載電子資料，都放在【download】目錄下面，那么，在插件中心那里，設置Zotfile的常用目錄是【download】目錄。如下圖所示：



繼續：



完工！未來(lái)我們下載電子書(shū)時(shí)，就會(huì )自動(dòng)導入。它的原理是這樣的：

1、假設在Zotero中，我們的鼠標正選中了丹尼特這本書(shū)的條目。

2、此時(shí)，我們通過(guò)瀏覽器，下載了這本書(shū)的電子版，保存在【download】目錄下面。那么，插件Zotfile就會(huì )識別出來(lái)，并且默認認為這個(gè)電子文件是該條目的附件。然后自動(dòng)導入過(guò)來(lái)。它默認支持pdf、doc、txt等格式，你也可以設置更多格式，如常用的epub、mobi格式，如下圖所示：




3、同時(shí)，導入文件成功后，會(huì )自動(dòng)將文件重命名為【作者_出版年份_文獻標題】這種格式。當然，你不喜歡這種文件名格式，也可以在剛才那里自定義其它命名方法。

成功后，如下圖所示：



以前那些亂七八糟的PDF怎么處理呢？我們可以將每本電子書(shū)拖到對應條目下面。然后批量重命名即可。如下圖所示：



## 問(wèn)題6：如何寫(xiě)筆記？

好了，收藏狂們一般非常樂(lè )意干前面5個(gè)步驟，卻不太喜歡干這個(gè)步驟：讀書(shū)與寫(xiě)筆記。

Zotero現已支持用Markdown格式寫(xiě)筆記，強！步驟如下，

1）在插件中心，安裝Markdown here插件，http://t.cn/8kxA5bG

 2）重啟后，找到條目，然后新建一筆記，如下圖所示：



我們開(kāi)始用Markdown語(yǔ)法寫(xiě)筆記。這是筆記原文。



按下快捷鍵：【ctrl+alt+m】，你用Markdown寫(xiě)的筆記就生成為漂亮的文檔了！下圖是生成效果：



什么？你還在問(wèn)：Markdown語(yǔ)法是什么？枉我推廣這么久。。。

去讀這里：[Markdown在線(xiàn)寫(xiě)作速成](http://joinwee.com/lesson/10/)

## 問(wèn)題7：Zotero如何配合altmetric分數？

什么是altmetric分數？它可以查出在論文互引網(wǎng)站、推特、科學(xué)博客、專(zhuān)業(yè)科學(xué)媒體上對論文的議論等。 當然，僅限國外科學(xué)媒體。

Zotero如何配合使用？我之前的兩篇老文章介紹比較詳細了，

* [如何查詢(xún)Altmetric分數](http://www.douban.com/note/282310988/)
* [Zotero（3）：平板與社交：再談研究輔助工具Zotero兼配套APP](http://www.yangzhiping.com/tech/zotero3.html)

這里重點(diǎn)講講平板上，如iPad上如何配合使用。

科技發(fā)展真快，zotero配合altmetric分數，可以按照論文社交媒體影響力，來(lái)排序了。這樣同行在看的重要論文一目了然了。如下圖所示：



將文獻按照altmetric分數排序即可。然后社交媒體影響越大的，就越排在前面。掃了一下今年我看的論文，同行熱議的，集中在：

* 1、研究方法的討論，第一篇就是；
* 2、計算社會(huì )科學(xué)類(lèi)，如第二篇就是Facebook線(xiàn)索識別人格；
* 3、某個(gè)生理區域的突破；
* 4、縱向跟蹤研究，如第五篇發(fā)現書(shū)呆子有利于保護認知老化。

## 問(wèn)題8：看資料看暈了，怎么辦？

有一種學(xué)問(wèn)，叫做【科學(xué)計量學(xué)】，研究【科學(xué)的科學(xué)】，之前也寫(xiě)過(guò)很多文章介紹了。比如這篇：

* [科學(xué)計量學(xué)：發(fā)現學(xué)科正在靜悄悄發(fā)生的革命](http://www.yangzhiping.com/tech/scientometrics-sci2.html)

其實(shí)，Zotero也可以完成類(lèi)似任務(wù)。這就是我之前介紹過(guò)的papermachine插件。下載地址在這里：

[How to Use Paper Machines | Paper Machines](http://papermachines.org/)

對一個(gè)類(lèi)別論文進(jìn)行【文獻可視化】分析，結果如下。先看詞云（Word Cloud）的分析結果，如下圖所示：



再看看Topic Modeling的分析結果。如下圖所示：



前者可以看出該子類(lèi)論文關(guān)鍵詞；后者可看出從1990到2010年，該研究領(lǐng)域隨時(shí)間的動(dòng)蕩。當然，我選擇的示范數據不好，并不能體現出其厲害之處。

一個(gè)不算遺憾的小提醒是，papermachine插件目前只支持英文等語(yǔ)種論文分析，另一個(gè)問(wèn)題是，它對版本兼容性要求較高。

## 問(wèn)題9：mendeley與 Zotero，哪個(gè)更好？

這又是一個(gè)讀者老問(wèn)我的問(wèn)題，誰(shuí)叫這個(gè)世界上，有一種叫做【選擇障礙】的病。這么說(shuō)吧，開(kāi)源世界的發(fā)展速度快于你的想象。 mendeley 被商業(yè)公司收購后，很多擁抱開(kāi)放科學(xué)理念的科學(xué)家，開(kāi)始抵制mendeley了，轉投Zotero懷抱。如這位：

* [Mendeley sells out; I’m moving to Zotero](http://research.coquipr.com/archives/492)

昨晚幫大家，再次測試mendeley，看一下它最新進(jìn)展如何，結果還是不得不放棄，安心用我的zotero。它的缺點(diǎn)有什么呢？

* 其一，對于文獻量龐大到一定程度的人，程序崩潰太頻繁；
* 其二，它的zotero整合功能，還是無(wú)法自動(dòng)導入子文件夾；
* 其三，搜索全方位弱于zotero，在Zotero中，我可以任意定義諸如【豆瓣近7天看的書(shū)】，【30天前看的BBS這本刊物的論文】，以備復習使用，而mendeley難以做到；
* 其四，mendeley超過(guò)2g空間就收費。Zotero至少10g空間隨便用。
* 其五，對于中國用戶(hù)來(lái)說(shuō)，mendeley還有個(gè)致命缺點(diǎn)，無(wú)法導入豆瓣讀書(shū)記錄與github的程序庫；無(wú)法將筆記與論文區分開(kāi)。這樣，只能將其當做文獻管理軟件而非知識管理軟件用。

貴陽(yáng)小楊哥(http://blog.yesmryang.net/tags/Zotero/)，也是忠實(shí)的開(kāi)源軟件Zotero推廣者，在我的微博評論下，補充道：

> Zotero早就可以把「附件」和「題錄」分開(kāi)放置了！附件放Dropbox/skydrive/百度盤(pán)什么的，20G不是問(wèn)題！

## 小結

開(kāi)源程序的發(fā)展速度往往超出人們想象。目前Zotero引領(lǐng)的開(kāi)源引文格式項目——[CSL](http://citationstyles.org/)，已經(jīng)突破六千多期刊。以致商業(yè)科技出版公司的人不敢相信。每過(guò)一些日子，你又會(huì )發(fā)現一些好用的小技巧。隔一段時(shí)間，對天天用的軟件，更新使用模式，是個(gè)好習慣。同時(shí)，開(kāi)源程序總具備一種質(zhì)樸的美。Zotero將電子書(shū)或PDF、筆記、引用文獻三者放在一起，從下載電子書(shū)或PDF，到閱讀、做標注、寫(xiě)筆記，再到引用，一條龍服務(wù)，非常方便。有特別不滿(mǎn)意的地方，源代碼公開(kāi)了，自己修改就好了。

我們還可以自定義這些zotero搜索類(lèi)別：【2013年看過(guò)的書(shū)】、【2013年看過(guò)的論文】與【2013年寫(xiě)過(guò)的讀書(shū)筆記】、【2013年閱讀的最重要的論文】或者【2013年同行評價(jià)最高的論文】。年底這么整理一下，溫故而知新，也很有成就感:D