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張鋒Nature Medicine綜述:基因編輯技術(shù)最新進(jìn)展


人體內已命名的基因共有25000多條,目前已知一部分基因(3000)的突變會(huì )引起各類(lèi)疾病。對于此類(lèi)疾病的治療,最本質(zhì)的手段是通過(guò)一些方法將突變后的遺傳物質(zhì)矯正回原來(lái)的狀態(tài)。這類(lèi)方法被稱(chēng)為遺傳療法(genetic therapies)。目前最廣泛的遺傳療法手段為:1. 以病毒載體感染方式引導的源基因導入;2. 以RNA干擾方式引導的目的基因表達下調。這些手段在治療嚴重復合型免疫缺陷疾?。⊿CID)以及Wiskott-Aldrich綜合征方面獲得了成功。盡管如此,RNAi技術(shù)在應用的廣泛性上還存在局限。

基因編輯技術(shù)(genome editing technologies)是針對DNA本身進(jìn)行的操作手段。最近應用型基因編輯領(lǐng)域的'鼻祖',美國麻省理工學(xué)院張鋒教授等人發(fā)表在《Nature Medicine》雜志上的一篇綜述詳細介紹了這些技術(shù)的原理以及在臨床上的應用前景。

基因編輯技術(shù)的基本原理

歸巢酶,ZFN,TALEN以及CRISPR/cas9四種核酸內切酶均能夠特異性地識別與切割特定的DNA序列,引起DNA雙鏈斷裂(DSB)。根據其識別方式的不同可以分為:蛋白質(zhì)與DNA的識別與切割,包括歸巢酶,ZFN,TALEN; RNA與DNA的識別與蛋白質(zhì)介導的切割,即CRISPR/cas9。在特異性方面,歸巢酶具有一個(gè)較大的DNA識別結構域,此結構同時(shí)負責DNA的切割;ZFN與TALEN是由多個(gè)酶亞基組成的復合體,分別具有特異性識別DNA的能力與 DNA內切活性。在應用方面,歸巢酶及ZFN需要通過(guò)人工突變的方式構造切割不同DNA序列的工程酶,LALEN則需要復雜的分子克隆達到此目的。與之不同,在CRISPR/cas9系統中,可以通過(guò)簡(jiǎn)單的sgRNA的變化達到切割不同的基因片段的目的。切割完成后,目的位點(diǎn)會(huì )出現雙鏈斷裂(DSB)的結果并引起生物體的主動(dòng)修復。NHDJ修復以另外一條未被切割的DNA鏈為模板,從而保證修復結果的準確。在反復不斷地斷裂-修復過(guò)程中,容易在切割位點(diǎn)造成插入或缺失突變,這樣就達到了造成基因紊亂的目的。另外,研究人員利用HDR的修復機制可以人為制造想要得到的突變結果,從而達到基因修復的效果。

基因編輯療法簡(jiǎn)介

基因編輯在疾病治療方面的應用模式主要為:矯正/沉默有害突變,插入保護性突變,加入治療性基因以及敲除病毒DNA。對于突變引起的有害基因的活化,可以通過(guò)簡(jiǎn)單的沉默或敲除的方式達到治療的目的,如亨廷頓氏舞蹈癥(一種顯性突變引起的家族性遺傳?。?,但是對于突變引起的正?;虻氖Щ?,則需要通過(guò)HDR的方式對目的序列進(jìn)行編輯,使其恢復到原有的健康狀態(tài),如泰薩氏病 (一種隱性基因突變引起的遺傳性疾?。?。

基因編輯的效率

基因編輯的效率受到編輯方式,細胞類(lèi)型,位點(diǎn)序列等多個(gè)因素的影響??傮w上來(lái)講,NHEJ要比HDR效率更高。對于我們更關(guān)心的HDR方式,主要受到4個(gè)因素的影響:1,修飾的本質(zhì),如改變的序列幅度;2,其識別特異性的干擾,如NHEJ可能干擾DSB造成的針對HDR的特異性序列,造成其效率的下降;3,破壞序列與改造序列的相似度;4,HDR拓撲結構。

具體治療手段與成功案例

目前常見(jiàn)的治療手段為體外治療與體內治療。體外治療為將病人體內需要被改造的細胞取出,在體外進(jìn)行培養與改造,然后將改造后的細胞導入體內;體內治療為直接將改造材料注入患者體內,可以是系統性地改造,也可以是局部的改造。體外改造的成功例子是講HIV攜帶者體內的CD4陽(yáng)性T細胞表面的CCR5受體進(jìn)行突變,然后導入體內,發(fā)現這一做法能夠有效提高患者CD4陽(yáng)性T細胞數量與減輕HIV惡化程度。體內感染的成功例子是對于小鼠B型血友病的治療,通過(guò)體內導入重組因子IX,小鼠病情得到了減輕。

雖然目前基因編輯編輯技術(shù)在安全性與效率方面取得了很大的進(jìn)步,但是在臨床應用方面還有很大的挑戰。我們需要一方面不斷提高基因編輯的效率,以期能夠以最小的代價(jià)得到有效治療;另外,我們還需要不斷探索這些核算內切酶的作用機制,從而能夠進(jìn)一步提高它們的特異性,將副作用降到最低。

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