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Cell|中美背靠背研究:驅動(dòng)衰老的表觀(guān)遺傳因素

衰老是人類(lèi)慢性疾病的最大危險因素,細胞衰老是機體衰老及各種衰老相關(guān)疾病發(fā)生發(fā)展的重要誘因,表觀(guān)遺傳作為基因表達之匙,其程序化改變被認為是決定細胞衰老進(jìn)程的關(guān)鍵因素。表觀(guān)遺傳的程序化改變如何驅動(dòng)衰老?表觀(guān)重編程能否延緩甚至逆轉衰老?日前,Cell雜志以背靠背形式發(fā)表了兩篇文章全面解析了表觀(guān)遺傳紊亂與衰老間的前因后果,為衰老干預,衰老相關(guān)疾病的防治帶來(lái)了新的曙光。

2023年1月19日,中國科學(xué)院動(dòng)物研究所劉光慧課題組、曲靜課題組和中國科學(xué)院北京基因組研究所張維綺課題組合作在Cell雜志發(fā)表題為Resurrection of endogenous retroviruses during aging reinforces senescence的研究論文。該研究首次發(fā)現了人類(lèi)基因組中內源性逆轉錄病毒(Endogenous Retrovirus, ERV)由于表觀(guān)遺傳失穩在細胞衰老過(guò)程中被再度喚醒,提出了古病毒復活介導衰老程序化及傳染性的理論,并且創(chuàng )新性地發(fā)展出阻斷ERV古病毒復活及擴散以實(shí)現延緩衰老的多維干預策略。

內源性逆轉錄病毒是數百萬(wàn)年前遠古逆轉錄病毒入侵整合到人類(lèi)基因組的遺跡,占據了人類(lèi)基因組序列的8%左右,在胚胎發(fā)育后,受宿主監控大多數處于表觀(guān)遺傳沉默狀態(tài)。研究團隊前期研究揭示了組成型異染色質(zhì)(constitutive heterochromatin)的減少(染色質(zhì)“熵增”)是人類(lèi)細胞衰老的表觀(guān)遺傳驅動(dòng)力(Science 2015,Nucleic Acids Research 2020, Science Translational Medicine 2021, Cell Research 2021, Developmental Cell 2022,Nature Aging 2022),并最早發(fā)現體細胞重編程有效擦除衰老細胞多維表觀(guān)遺傳特征(DNA甲基化、組蛋白修飾、端粒狀態(tài)),撥回衰老/早衰時(shí)鐘(Nature 2011)。在該項研究中,研究團隊利用前期建立的多種衰老研究體系,結合多學(xué)科交叉技術(shù),發(fā)現衰老細胞中表觀(guān)遺傳“熵增”導致基因組中ERV的轉錄激活并翻譯出病毒蛋白,進(jìn)而包裝成為病毒顆粒。一方面,衰老細胞中ERV的反轉錄產(chǎn)物通過(guò)激活cGAS-STING天然免疫通路誘發(fā)細胞衰老和炎癥;另一方面,衰老細胞釋放的ERV病毒顆??赏ㄟ^(guò)旁分泌或體液介導的方式在器官、組織、細胞間有效傳遞并放大衰老信號,最終使得年輕細胞因受“感染”而老化。進(jìn)一步,通過(guò)對ERV古病毒潛伏、復活、細胞間傳遞等不同生命周期環(huán)節的解析,研究人員開(kāi)發(fā)出有效抑制ERV古病毒復活及清除病毒顆粒的干預策略,即通過(guò)發(fā)展基于靶向ERV調控元件的CRISPR基因沉默體系、靶向逆轉錄酶的小分子抑制藥物、靶向病毒包膜蛋白的中和抗體等技術(shù),阻斷ERV的轉錄、反轉錄、病毒級聯(lián)感染等多個(gè)環(huán)節,進(jìn)而實(shí)現了組織和機體衰老的延緩??偟膩?lái)說(shuō)該研究系統定義并揭示了表觀(guān)程序化改變驅動(dòng)的內源性逆轉錄病毒復活(aging-induced resurrection of endogenous retrovirus, AIR-ERV)可以作為細胞、器官乃至機體衰老的驅動(dòng)力及度量標志物,為衰老的程序化、級聯(lián)放大和可干預性提供了全新的理論依據,為人類(lèi)衰老的科學(xué)評估和預警、衰老及衰老相關(guān)疾病的防治提供了重要的線(xiàn)索和思路。


該工作被Cell出版集團遴選為Cell頭條論文。桑福德伯納姆普利貝斯醫學(xué)研究所的Peter Adams教授在Cell期刊上發(fā)表了對這篇文章的特邀評價(jià)(Preview),表示這項研究為衰老的潛在機制提供了新的見(jiàn)解,并表明內源性逆轉錄病毒的激活可能是衰老的驅動(dòng)力之一,提高了人們對衰老的理解,幫助新干預措施的開(kāi)發(fā)以促進(jìn)健康衰老。

同時(shí),Nature Reviews Molecular Cell Biology期刊對該成果進(jìn)行了即時(shí)亮點(diǎn)評論(Research Highlights)。評論中表示,該研究揭示了內源性逆轉錄病毒可以促進(jìn)細胞衰老和組織衰老,并且是增加人類(lèi)健康壽命的潛在藥物靶點(diǎn),同時(shí)也提出了病毒傳染在衰老過(guò)程中發(fā)揮作用的可能性。

2023年1月19日,來(lái)自美國哈佛醫學(xué)院的David Sinclair研究團隊也在同期Cell雜志發(fā)表題為Loss of epigenetic information as a cause of mammalian aging的研究論文。該研究開(kāi)發(fā)了一套表觀(guān)信息重置系統,證明了非突變的雙鏈DNA斷裂(DSB)修復反應會(huì )導致表觀(guān)遺傳信息的紊亂,造成細胞衰老,而表觀(guān)基因組重編程可以在一定程度上逆轉衰老。

雙鏈DNA斷裂是導致表觀(guān)基因組隨時(shí)間變化的主要因素之一。David Sinclair團隊曾提出觀(guān)點(diǎn),認為DNA損傷引起的染色質(zhì)修飾因子重新定位所導致的表觀(guān)遺傳變化可能是衰老的主要原因,稱(chēng)為染色質(zhì)修飾因子重新定位(RCM)假說(shuō)。研究人員構建了誘導型表觀(guān)組改變(ICE)細胞與小鼠體系,發(fā)現DNA損傷及其修復過(guò)程會(huì )擾亂ICE細胞的組蛋白修飾水平和富集區域,使其變?yōu)榛靵y的衰老狀態(tài)。同時(shí),DNA損傷還會(huì )改變染色質(zhì)的空間組織和各染色質(zhì)區域之間的相互作用,進(jìn)而擾亂基因的正常表達模式,使得細胞的發(fā)育過(guò)程和身份特征受到破壞。但是使用過(guò)表達Yamanaka因子Oct4、Sox2和Klf4(OSK)來(lái)重塑表觀(guān)基因組,可以使ICE小鼠肝臟和肌肉的表觀(guān)基因組恢復到年輕水平。

The Scientist雜志發(fā)表了針對該項工作的特別評論文章。其中,來(lái)自中國科學(xué)院的劉光慧教授評價(jià):“ICE體系是一個(gè)簡(jiǎn)潔巧妙的研究體系,在不誘導突變的前提下產(chǎn)生了DSB,實(shí)現了表觀(guān)遺傳衰老的誘導”。此外,來(lái)自美國羅切斯特大學(xué)的Vera Gorbunova教授表示,如果能發(fā)現一種非常安全的方法,該項研究成果可能具有恢復細胞表觀(guān)遺傳信息的臨床應用潛力。

上述兩項研究成果再一次證實(shí)了表觀(guān)遺傳改變是誘導衰老的主要驅動(dòng)因素,表觀(guān)遺傳的干預能在一定程度上延緩衰老,為解析衰老的規律和發(fā)展衰老的干預策略開(kāi)辟了嶄新的研究方向,為人類(lèi)衰老及其相關(guān)疾病的早期預警和科學(xué)防治提供了新思路,對推動(dòng)老年醫學(xué)基礎研究和臨床轉化研究的發(fā)展具有重要意義。

原文鏈接

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(22)01530-6

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(22)01570-7

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(22)01583-5

https://www.nature.com/articles/s41580-023-00580-4

https://www.the-scientist.com/news-opinion/epigenetic-manipulations-can-accelerate-or-reverse-aging-in-mice-70888




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