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網(wǎng)格應用--天之痕

網(wǎng)格應用平臺及其典型應用建設--生物信息學(xué)網(wǎng)格

該項目基于山東省高性能計算中心,建立一個(gè)可用于生物信息學(xué)相關(guān)計算、存貯及共享的應用網(wǎng)格平臺。將校園網(wǎng)內的各種計算資源以有效的方式組織起來(lái),隱藏其內部異構性和動(dòng)態(tài)性,向網(wǎng)上生物信息學(xué)用戶(hù)提供統一的透明網(wǎng)格服務(wù)。

具體研究?jì)热莅ǎ?/font>

(一)應用網(wǎng)格核心硬件環(huán)境的建立

基于山東大學(xué)校園網(wǎng),將山東省高性能計算中心的IBM690(2000億次)和浪潮機群(萬(wàn)億次)、生命學(xué)院的SGI O2等機器作為網(wǎng)格的結點(diǎn)連接起來(lái),構成山東大學(xué)應用網(wǎng)格的核心硬件環(huán)境,并能方便地與其它可利用的計算資源建立有效的連接。 

(二)應用軟件、數據資源共享與開(kāi)發(fā)

(1) 山東大學(xué)生物數據庫的存貯與共享研究,用于數據庫搜尋、序列比對、DNA片段拼裝、進(jìn)化分析以及蛋白質(zhì)分析的軟件包GCG Wisconsin Package的共享使用方式。

(2) 與香港城市大學(xué)合作進(jìn)行計算生物學(xué)中相關(guān)算法研究,研制開(kāi)發(fā)用于基因序列translocation距離、reversal距離的計算軟件包。

(三)中間件軟件的研制與開(kāi)發(fā)

(1)應用網(wǎng)格的用戶(hù)認證、授權系統

在一個(gè)開(kāi)放、共享的網(wǎng)格環(huán)境中,完成用戶(hù)的認證與授權系統,提供網(wǎng)格系統最基本的安全功能。

(2)應用網(wǎng)格計費系統

依據資源的使用任務(wù)的要求,提供應用網(wǎng)格用戶(hù)使用資源的計費功能,作為對應用網(wǎng)格用戶(hù)進(jìn)行收費和服務(wù)質(zhì)量保證的依據。

(3)應用網(wǎng)格服務(wù)訪(fǎng)問(wèn)方法

提供應用網(wǎng)格服務(wù)的訪(fǎng)問(wèn)方法,包括服務(wù)描述及服務(wù)請求等。

(四)應用網(wǎng)格門(mén)戶(hù)的建立

建立應用網(wǎng)格門(mén)戶(hù),為用戶(hù)提供簡(jiǎn)單的使用界面,并提供方便的網(wǎng)格資源使用模式、用戶(hù)與網(wǎng)格資源的交互方式等,形成一種靈活的應用網(wǎng)格服務(wù)展現和訪(fǎng)問(wèn)方式。

提供與教育網(wǎng)格內同類(lèi)應用網(wǎng)格接入的設備與相應軟件。通過(guò)校園網(wǎng)格與中國教育科研計算機網(wǎng)用戶(hù)共享計算資源。 

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